Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y259

CHKB, Choline/ethanolamine kinase, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHKBQ9Y259 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CHKBQ9Y259 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CHKBQ9Y259 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CHKBQ9Y259 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CHKBQ9Y259 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
CHKBQ9Y259 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CHKBQ9Y259 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CHKBQ9Y259 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CHKBQ9Y259 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CHKBQ9Y259 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CHKBQ9Y259 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CHKBQ9Y259 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
CHKBQ9Y259 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CHKBQ9Y259 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CHKBQ9Y259 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CHKBQ9Y259 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CHKBQ9Y259 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CHKBQ9Y259 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CHKBQ9Y259 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CHKBQ9Y259 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CHKBQ9Y259 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
CHKBQ9Y259 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CHKBQ9Y259 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CHKBQ9Y259 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CHKBQ9Y259 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CHKBQ9Y259 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CHKBQ9Y259 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CHKBQ9Y259 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CHKBQ9Y259 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CHKBQ9Y259 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CHKBQ9Y259 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CHKBQ9Y259 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CHKBQ9Y259 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CHKBQ9Y259 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CHKBQ9Y259 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CHKBQ9Y259 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CHKBQ9Y259 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CHKBQ9Y259 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CHKBQ9Y259 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CHKBQ9Y259 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CHKBQ9Y259 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CHKBQ9Y259 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CHKBQ9Y259 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CHKBQ9Y259 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
CHKBQ9Y259 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CHKBQ9Y259 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CHKBQ9Y259 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CHKBQ9Y259 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CHKBQ9Y259 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CHKBQ9Y259 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
CHKBQ9Y259 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CHKBQ9Y259 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CHKBQ9Y259 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CHKBQ9Y259 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CHKBQ9Y259 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CHKBQ9Y259 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CHKBQ9Y259 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CHKBQ9Y259 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CHKBQ9Y259 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CHKBQ9Y259 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CHKBQ9Y259 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CHKBQ9Y259 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CHKBQ9Y259 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CHKBQ9Y259 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CHKBQ9Y259 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
CHKBQ9Y259 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CHKBQ9Y259 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CHKBQ9Y259 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CHKBQ9Y259 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CHKBQ9Y259 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CHKBQ9Y259 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CHKBQ9Y259 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CHKBQ9Y259 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CHKBQ9Y259 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CHKBQ9Y259 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CHKBQ9Y259 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
CHKBQ9Y259 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CHKBQ9Y259 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CHKBQ9Y259 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CHKBQ9Y259 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CHKBQ9Y259 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CHKBQ9Y259 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CHKBQ9Y259 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CHKBQ9Y259 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
CHKBQ9Y259 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CHKBQ9Y259 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CHKBQ9Y259 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CHKBQ9Y259 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CHKBQ9Y259 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CHKBQ9Y259 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CHKBQ9Y259 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CHKBQ9Y259 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CHKBQ9Y259 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CHKBQ9Y259 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CHKBQ9Y259 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CHKBQ9Y259 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CHKBQ9Y259 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CHKBQ9Y259 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CHKBQ9Y259 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CHKBQ9Y259 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms