Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y241

HIGD1A, HIG1 domain family member 1A, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIGD1AQ9Y241 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HIGD1AQ9Y241 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
HIGD1AQ9Y241 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HIGD1AQ9Y241 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HIGD1AQ9Y241 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HIGD1AQ9Y241 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HIGD1AQ9Y241 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HIGD1AQ9Y241 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
HIGD1AQ9Y241 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
HIGD1AQ9Y241 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
HIGD1AQ9Y241 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
HIGD1AQ9Y241 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
HIGD1AQ9Y241 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
HIGD1AQ9Y241 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
HIGD1AQ9Y241 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
HIGD1AQ9Y241 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
HIGD1AQ9Y241 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
HIGD1AQ9Y241 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
HIGD1AQ9Y241 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
HIGD1AQ9Y241 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
HIGD1AQ9Y241 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
HIGD1AQ9Y241 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
HIGD1AQ9Y241 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
HIGD1AQ9Y241 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
HIGD1AQ9Y241 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
HIGD1AQ9Y241 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
HIGD1AQ9Y241 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
HIGD1AQ9Y241 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
HIGD1AQ9Y241 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
HIGD1AQ9Y241 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
HIGD1AQ9Y241 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
HIGD1AQ9Y241 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
HIGD1AQ9Y241 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
HIGD1AQ9Y241 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
HIGD1AQ9Y241 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
HIGD1AQ9Y241 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HIGD1AQ9Y241 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HIGD1AQ9Y241 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HIGD1AQ9Y241 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
HIGD1AQ9Y241 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HIGD1AQ9Y241 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
HIGD1AQ9Y241 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HIGD1AQ9Y241 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
HIGD1AQ9Y241 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
HIGD1AQ9Y241 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HIGD1AQ9Y241 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HIGD1AQ9Y241 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HIGD1AQ9Y241 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HIGD1AQ9Y241 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
HIGD1AQ9Y241 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HIGD1AQ9Y241 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
HIGD1AQ9Y241 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HIGD1AQ9Y241 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HIGD1AQ9Y241 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HIGD1AQ9Y241 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HIGD1AQ9Y241 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HIGD1AQ9Y241 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HIGD1AQ9Y241 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HIGD1AQ9Y241 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HIGD1AQ9Y241 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HIGD1AQ9Y241 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HIGD1AQ9Y241 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HIGD1AQ9Y241 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HIGD1AQ9Y241 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HIGD1AQ9Y241 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HIGD1AQ9Y241 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
HIGD1AQ9Y241 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HIGD1AQ9Y241 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HIGD1AQ9Y241 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HIGD1AQ9Y241 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HIGD1AQ9Y241 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HIGD1AQ9Y241 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HIGD1AQ9Y241 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HIGD1AQ9Y241 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HIGD1AQ9Y241 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HIGD1AQ9Y241 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HIGD1AQ9Y241 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HIGD1AQ9Y241 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HIGD1AQ9Y241 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
HIGD1AQ9Y241 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HIGD1AQ9Y241 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HIGD1AQ9Y241 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HIGD1AQ9Y241 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HIGD1AQ9Y241 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HIGD1AQ9Y241 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HIGD1AQ9Y241 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
HIGD1AQ9Y241 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HIGD1AQ9Y241 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HIGD1AQ9Y241 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
HIGD1AQ9Y241 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HIGD1AQ9Y241 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
HIGD1AQ9Y241 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
HIGD1AQ9Y241 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
HIGD1AQ9Y241 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
HIGD1AQ9Y241 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
HIGD1AQ9Y241 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
HIGD1AQ9Y241 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
HIGD1AQ9Y241 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
HIGD1AQ9Y241 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
HIGD1AQ9Y241 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms