Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPU3

SORCS3, VPS10 domain-containing receptor SorCS3, humanhuman

Predictions only

Length 1,222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SORCS3Q9UPU3 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SORCS3Q9UPU3 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
SORCS3Q9UPU3 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
SORCS3Q9UPU3 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SORCS3Q9UPU3 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SORCS3Q9UPU3 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
SORCS3Q9UPU3 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
SORCS3Q9UPU3 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SORCS3Q9UPU3 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
SORCS3Q9UPU3 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
SORCS3Q9UPU3 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
SORCS3Q9UPU3 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
SORCS3Q9UPU3 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
SORCS3Q9UPU3 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
SORCS3Q9UPU3 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SORCS3Q9UPU3 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SORCS3Q9UPU3 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SORCS3Q9UPU3 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SORCS3Q9UPU3 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
SORCS3Q9UPU3 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SORCS3Q9UPU3 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SORCS3Q9UPU3 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SORCS3Q9UPU3 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SORCS3Q9UPU3 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
SORCS3Q9UPU3 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SORCS3Q9UPU3 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SORCS3Q9UPU3 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SORCS3Q9UPU3 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SORCS3Q9UPU3 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SORCS3Q9UPU3 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SORCS3Q9UPU3 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SORCS3Q9UPU3 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SORCS3Q9UPU3 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SORCS3Q9UPU3 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SORCS3Q9UPU3 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SORCS3Q9UPU3 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SORCS3Q9UPU3 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SORCS3Q9UPU3 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SORCS3Q9UPU3 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SORCS3Q9UPU3 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SORCS3Q9UPU3 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SORCS3Q9UPU3 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SORCS3Q9UPU3 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SORCS3Q9UPU3 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SORCS3Q9UPU3 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SORCS3Q9UPU3 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SORCS3Q9UPU3 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SORCS3Q9UPU3 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SORCS3Q9UPU3 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SORCS3Q9UPU3 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SORCS3Q9UPU3 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SORCS3Q9UPU3 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SORCS3Q9UPU3 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SORCS3Q9UPU3 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SORCS3Q9UPU3 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
SORCS3Q9UPU3 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SORCS3Q9UPU3 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SORCS3Q9UPU3 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SORCS3Q9UPU3 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SORCS3Q9UPU3 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SORCS3Q9UPU3 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SORCS3Q9UPU3 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SORCS3Q9UPU3 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SORCS3Q9UPU3 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SORCS3Q9UPU3 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SORCS3Q9UPU3 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SORCS3Q9UPU3 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
SORCS3Q9UPU3 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SORCS3Q9UPU3 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SORCS3Q9UPU3 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SORCS3Q9UPU3 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SORCS3Q9UPU3 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SORCS3Q9UPU3 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SORCS3Q9UPU3 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SORCS3Q9UPU3 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SORCS3Q9UPU3 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SORCS3Q9UPU3 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
SORCS3Q9UPU3 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SORCS3Q9UPU3 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SORCS3Q9UPU3 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SORCS3Q9UPU3 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SORCS3Q9UPU3 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SORCS3Q9UPU3 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SORCS3Q9UPU3 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SORCS3Q9UPU3 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SORCS3Q9UPU3 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SORCS3Q9UPU3 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
SORCS3Q9UPU3 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SORCS3Q9UPU3 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SORCS3Q9UPU3 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SORCS3Q9UPU3 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SORCS3Q9UPU3 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
SORCS3Q9UPU3 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SORCS3Q9UPU3 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SORCS3Q9UPU3 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SORCS3Q9UPU3 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SORCS3Q9UPU3 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SORCS3Q9UPU3 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SORCS3Q9UPU3 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
SORCS3Q9UPU3 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.8 ms