Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNH6

SNX7, Sorting nexin-7, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX7Q9UNH6 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SNX7Q9UNH6 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SNX7Q9UNH6 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SNX7Q9UNH6 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SNX7Q9UNH6 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SNX7Q9UNH6 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SNX7Q9UNH6 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SNX7Q9UNH6 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SNX7Q9UNH6 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SNX7Q9UNH6 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SNX7Q9UNH6 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SNX7Q9UNH6 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SNX7Q9UNH6 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SNX7Q9UNH6 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SNX7Q9UNH6 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SNX7Q9UNH6 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SNX7Q9UNH6 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SNX7Q9UNH6 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SNX7Q9UNH6 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SNX7Q9UNH6 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SNX7Q9UNH6 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SNX7Q9UNH6 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SNX7Q9UNH6 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SNX7Q9UNH6 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SNX7Q9UNH6 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SNX7Q9UNH6 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SNX7Q9UNH6 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SNX7Q9UNH6 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SNX7Q9UNH6 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SNX7Q9UNH6 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SNX7Q9UNH6 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SNX7Q9UNH6 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SNX7Q9UNH6 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SNX7Q9UNH6 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SNX7Q9UNH6 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SNX7Q9UNH6 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SNX7Q9UNH6 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SNX7Q9UNH6 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SNX7Q9UNH6 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SNX7Q9UNH6 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SNX7Q9UNH6 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SNX7Q9UNH6 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SNX7Q9UNH6 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SNX7Q9UNH6 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SNX7Q9UNH6 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SNX7Q9UNH6 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SNX7Q9UNH6 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SNX7Q9UNH6 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SNX7Q9UNH6 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SNX7Q9UNH6 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SNX7Q9UNH6 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SNX7Q9UNH6 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SNX7Q9UNH6 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SNX7Q9UNH6 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SNX7Q9UNH6 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SNX7Q9UNH6 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SNX7Q9UNH6 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SNX7Q9UNH6 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SNX7Q9UNH6 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SNX7Q9UNH6 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SNX7Q9UNH6 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SNX7Q9UNH6 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SNX7Q9UNH6 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SNX7Q9UNH6 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SNX7Q9UNH6 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SNX7Q9UNH6 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SNX7Q9UNH6 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SNX7Q9UNH6 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SNX7Q9UNH6 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
SNX7Q9UNH6 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SNX7Q9UNH6 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SNX7Q9UNH6 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SNX7Q9UNH6 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
SNX7Q9UNH6 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SNX7Q9UNH6 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SNX7Q9UNH6 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SNX7Q9UNH6 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SNX7Q9UNH6 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SNX7Q9UNH6 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SNX7Q9UNH6 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SNX7Q9UNH6 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SNX7Q9UNH6 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SNX7Q9UNH6 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SNX7Q9UNH6 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SNX7Q9UNH6 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SNX7Q9UNH6 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SNX7Q9UNH6 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SNX7Q9UNH6 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SNX7Q9UNH6 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SNX7Q9UNH6 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
SNX7Q9UNH6 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
SNX7Q9UNH6 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SNX7Q9UNH6 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SNX7Q9UNH6 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SNX7Q9UNH6 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SNX7Q9UNH6 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SNX7Q9UNH6 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SNX7Q9UNH6 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SNX7Q9UNH6 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SNX7Q9UNH6 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.1 ms