Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMX5

NENF, Neudesin, humanhuman

Predictions only

Length 172 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NENFQ9UMX5 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
NENFQ9UMX5 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NENFQ9UMX5 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NENFQ9UMX5 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NENFQ9UMX5 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
NENFQ9UMX5 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NENFQ9UMX5 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NENFQ9UMX5 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NENFQ9UMX5 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NENFQ9UMX5 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NENFQ9UMX5 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NENFQ9UMX5 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NENFQ9UMX5 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
NENFQ9UMX5 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NENFQ9UMX5 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NENFQ9UMX5 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NENFQ9UMX5 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
NENFQ9UMX5 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
NENFQ9UMX5 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
NENFQ9UMX5 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
NENFQ9UMX5 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.42
NENFQ9UMX5 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
NENFQ9UMX5 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
NENFQ9UMX5 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
NENFQ9UMX5 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
NENFQ9UMX5 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NENFQ9UMX5 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
NENFQ9UMX5 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
NENFQ9UMX5 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
NENFQ9UMX5 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
NENFQ9UMX5 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC23.88■■□□□ 1.41
NENFQ9UMX5 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
NENFQ9UMX5 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NENFQ9UMX5 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
NENFQ9UMX5 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
NENFQ9UMX5 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NENFQ9UMX5 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NENFQ9UMX5 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NENFQ9UMX5 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NENFQ9UMX5 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NENFQ9UMX5 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NENFQ9UMX5 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
NENFQ9UMX5 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NENFQ9UMX5 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NENFQ9UMX5 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NENFQ9UMX5 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NENFQ9UMX5 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NENFQ9UMX5 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
NENFQ9UMX5 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NENFQ9UMX5 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NENFQ9UMX5 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NENFQ9UMX5 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NENFQ9UMX5 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
NENFQ9UMX5 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
NENFQ9UMX5 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
NENFQ9UMX5 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NENFQ9UMX5 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NENFQ9UMX5 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NENFQ9UMX5 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NENFQ9UMX5 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NENFQ9UMX5 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
NENFQ9UMX5 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
NENFQ9UMX5 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NENFQ9UMX5 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
NENFQ9UMX5 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
NENFQ9UMX5 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
NENFQ9UMX5 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
NENFQ9UMX5 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NENFQ9UMX5 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
NENFQ9UMX5 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
NENFQ9UMX5 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
NENFQ9UMX5 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
NENFQ9UMX5 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NENFQ9UMX5 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NENFQ9UMX5 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
NENFQ9UMX5 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
NENFQ9UMX5 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
NENFQ9UMX5 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
NENFQ9UMX5 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
NENFQ9UMX5 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
NENFQ9UMX5 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
NENFQ9UMX5 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
NENFQ9UMX5 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
NENFQ9UMX5 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
NENFQ9UMX5 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
NENFQ9UMX5 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
NENFQ9UMX5 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
NENFQ9UMX5 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
NENFQ9UMX5 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
NENFQ9UMX5 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
NENFQ9UMX5 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
NENFQ9UMX5 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
NENFQ9UMX5 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
NENFQ9UMX5 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
NENFQ9UMX5 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
NENFQ9UMX5 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
NENFQ9UMX5 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
NENFQ9UMX5 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
NENFQ9UMX5 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
NENFQ9UMX5 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.7 ms