Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMR5

PPT2, Lysosomal thioesterase PPT2, humanhuman

Predictions only

Length 302 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPT2Q9UMR5 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PPT2Q9UMR5 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PPT2Q9UMR5 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PPT2Q9UMR5 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PPT2Q9UMR5 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PPT2Q9UMR5 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PPT2Q9UMR5 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PPT2Q9UMR5 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PPT2Q9UMR5 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PPT2Q9UMR5 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PPT2Q9UMR5 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
PPT2Q9UMR5 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PPT2Q9UMR5 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PPT2Q9UMR5 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PPT2Q9UMR5 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PPT2Q9UMR5 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PPT2Q9UMR5 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PPT2Q9UMR5 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PPT2Q9UMR5 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PPT2Q9UMR5 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PPT2Q9UMR5 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PPT2Q9UMR5 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PPT2Q9UMR5 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PPT2Q9UMR5 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PPT2Q9UMR5 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PPT2Q9UMR5 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PPT2Q9UMR5 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PPT2Q9UMR5 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PPT2Q9UMR5 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PPT2Q9UMR5 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
PPT2Q9UMR5 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PPT2Q9UMR5 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PPT2Q9UMR5 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PPT2Q9UMR5 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PPT2Q9UMR5 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PPT2Q9UMR5 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PPT2Q9UMR5 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PPT2Q9UMR5 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PPT2Q9UMR5 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PPT2Q9UMR5 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PPT2Q9UMR5 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
PPT2Q9UMR5 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PPT2Q9UMR5 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PPT2Q9UMR5 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PPT2Q9UMR5 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PPT2Q9UMR5 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PPT2Q9UMR5 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PPT2Q9UMR5 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PPT2Q9UMR5 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
PPT2Q9UMR5 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PPT2Q9UMR5 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PPT2Q9UMR5 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PPT2Q9UMR5 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PPT2Q9UMR5 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PPT2Q9UMR5 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PPT2Q9UMR5 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PPT2Q9UMR5 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
PPT2Q9UMR5 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PPT2Q9UMR5 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PPT2Q9UMR5 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PPT2Q9UMR5 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PPT2Q9UMR5 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PPT2Q9UMR5 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PPT2Q9UMR5 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PPT2Q9UMR5 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PPT2Q9UMR5 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PPT2Q9UMR5 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
PPT2Q9UMR5 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PPT2Q9UMR5 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PPT2Q9UMR5 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PPT2Q9UMR5 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PPT2Q9UMR5 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PPT2Q9UMR5 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PPT2Q9UMR5 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PPT2Q9UMR5 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PPT2Q9UMR5 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PPT2Q9UMR5 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PPT2Q9UMR5 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PPT2Q9UMR5 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PPT2Q9UMR5 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PPT2Q9UMR5 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PPT2Q9UMR5 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PPT2Q9UMR5 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PPT2Q9UMR5 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PPT2Q9UMR5 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PPT2Q9UMR5 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PPT2Q9UMR5 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PPT2Q9UMR5 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PPT2Q9UMR5 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PPT2Q9UMR5 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PPT2Q9UMR5 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PPT2Q9UMR5 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PPT2Q9UMR5 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PPT2Q9UMR5 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PPT2Q9UMR5 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PPT2Q9UMR5 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PPT2Q9UMR5 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PPT2Q9UMR5 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PPT2Q9UMR5 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PPT2Q9UMR5 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.2 ms