Protein–RNA interactions for Protein: Q9UM22

EPDR1, Mammalian ependymin-related protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPDR1Q9UM22 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
EPDR1Q9UM22 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
EPDR1Q9UM22 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
EPDR1Q9UM22 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
EPDR1Q9UM22 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
EPDR1Q9UM22 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
EPDR1Q9UM22 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
EPDR1Q9UM22 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
EPDR1Q9UM22 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
EPDR1Q9UM22 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
EPDR1Q9UM22 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
EPDR1Q9UM22 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
EPDR1Q9UM22 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
EPDR1Q9UM22 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
EPDR1Q9UM22 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
EPDR1Q9UM22 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
EPDR1Q9UM22 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
EPDR1Q9UM22 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
EPDR1Q9UM22 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
EPDR1Q9UM22 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
EPDR1Q9UM22 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
EPDR1Q9UM22 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
EPDR1Q9UM22 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
EPDR1Q9UM22 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
EPDR1Q9UM22 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
EPDR1Q9UM22 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
EPDR1Q9UM22 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
EPDR1Q9UM22 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
EPDR1Q9UM22 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
EPDR1Q9UM22 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
EPDR1Q9UM22 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
EPDR1Q9UM22 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
EPDR1Q9UM22 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
EPDR1Q9UM22 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
EPDR1Q9UM22 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
EPDR1Q9UM22 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
EPDR1Q9UM22 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
EPDR1Q9UM22 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
EPDR1Q9UM22 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
EPDR1Q9UM22 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
EPDR1Q9UM22 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
EPDR1Q9UM22 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
EPDR1Q9UM22 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
EPDR1Q9UM22 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
EPDR1Q9UM22 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
EPDR1Q9UM22 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
EPDR1Q9UM22 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
EPDR1Q9UM22 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
EPDR1Q9UM22 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
EPDR1Q9UM22 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
EPDR1Q9UM22 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
EPDR1Q9UM22 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
EPDR1Q9UM22 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
EPDR1Q9UM22 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
EPDR1Q9UM22 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
EPDR1Q9UM22 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
EPDR1Q9UM22 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
EPDR1Q9UM22 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
EPDR1Q9UM22 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
EPDR1Q9UM22 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
EPDR1Q9UM22 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
EPDR1Q9UM22 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
EPDR1Q9UM22 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
EPDR1Q9UM22 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
EPDR1Q9UM22 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
EPDR1Q9UM22 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
EPDR1Q9UM22 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
EPDR1Q9UM22 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
EPDR1Q9UM22 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
EPDR1Q9UM22 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
EPDR1Q9UM22 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
EPDR1Q9UM22 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
EPDR1Q9UM22 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
EPDR1Q9UM22 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
EPDR1Q9UM22 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
EPDR1Q9UM22 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
EPDR1Q9UM22 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
EPDR1Q9UM22 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
EPDR1Q9UM22 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
EPDR1Q9UM22 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
EPDR1Q9UM22 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
EPDR1Q9UM22 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
EPDR1Q9UM22 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
EPDR1Q9UM22 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
EPDR1Q9UM22 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
EPDR1Q9UM22 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
EPDR1Q9UM22 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
EPDR1Q9UM22 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
EPDR1Q9UM22 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
EPDR1Q9UM22 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
EPDR1Q9UM22 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
EPDR1Q9UM22 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
EPDR1Q9UM22 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
EPDR1Q9UM22 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
EPDR1Q9UM22 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
EPDR1Q9UM22 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
EPDR1Q9UM22 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
EPDR1Q9UM22 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
EPDR1Q9UM22 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
EPDR1Q9UM22 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms