Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULH4

LRFN2, Leucine-rich repeat and fibronectin type-III domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 789 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRFN2Q9ULH4 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
LRFN2Q9ULH4 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
LRFN2Q9ULH4 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LRFN2Q9ULH4 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LRFN2Q9ULH4 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
LRFN2Q9ULH4 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
LRFN2Q9ULH4 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LRFN2Q9ULH4 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LRFN2Q9ULH4 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LRFN2Q9ULH4 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
LRFN2Q9ULH4 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LRFN2Q9ULH4 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
LRFN2Q9ULH4 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
LRFN2Q9ULH4 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LRFN2Q9ULH4 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LRFN2Q9ULH4 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
LRFN2Q9ULH4 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
LRFN2Q9ULH4 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
LRFN2Q9ULH4 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
LRFN2Q9ULH4 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC24.36■■□□□ 1.49
LRFN2Q9ULH4 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
LRFN2Q9ULH4 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
LRFN2Q9ULH4 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
LRFN2Q9ULH4 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
LRFN2Q9ULH4 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
LRFN2Q9ULH4 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
LRFN2Q9ULH4 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
LRFN2Q9ULH4 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LRFN2Q9ULH4 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
LRFN2Q9ULH4 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
LRFN2Q9ULH4 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LRFN2Q9ULH4 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
LRFN2Q9ULH4 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LRFN2Q9ULH4 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
LRFN2Q9ULH4 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LRFN2Q9ULH4 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LRFN2Q9ULH4 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
LRFN2Q9ULH4 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LRFN2Q9ULH4 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LRFN2Q9ULH4 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
LRFN2Q9ULH4 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
LRFN2Q9ULH4 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
LRFN2Q9ULH4 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
LRFN2Q9ULH4 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
LRFN2Q9ULH4 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
LRFN2Q9ULH4 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
LRFN2Q9ULH4 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
LRFN2Q9ULH4 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
LRFN2Q9ULH4 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
LRFN2Q9ULH4 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
LRFN2Q9ULH4 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
LRFN2Q9ULH4 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
LRFN2Q9ULH4 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LRFN2Q9ULH4 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
LRFN2Q9ULH4 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LRFN2Q9ULH4 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
LRFN2Q9ULH4 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
LRFN2Q9ULH4 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LRFN2Q9ULH4 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.32■■□□□ 1.48
LRFN2Q9ULH4 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LRFN2Q9ULH4 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
LRFN2Q9ULH4 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
LRFN2Q9ULH4 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
LRFN2Q9ULH4 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LRFN2Q9ULH4 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
LRFN2Q9ULH4 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LRFN2Q9ULH4 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LRFN2Q9ULH4 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LRFN2Q9ULH4 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
LRFN2Q9ULH4 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LRFN2Q9ULH4 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
LRFN2Q9ULH4 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
LRFN2Q9ULH4 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
LRFN2Q9ULH4 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LRFN2Q9ULH4 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LRFN2Q9ULH4 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
LRFN2Q9ULH4 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LRFN2Q9ULH4 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
LRFN2Q9ULH4 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LRFN2Q9ULH4 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
LRFN2Q9ULH4 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
LRFN2Q9ULH4 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
LRFN2Q9ULH4 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
LRFN2Q9ULH4 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LRFN2Q9ULH4 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
LRFN2Q9ULH4 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC24.3■■□□□ 1.48
LRFN2Q9ULH4 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LRFN2Q9ULH4 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LRFN2Q9ULH4 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LRFN2Q9ULH4 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LRFN2Q9ULH4 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LRFN2Q9ULH4 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LRFN2Q9ULH4 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LRFN2Q9ULH4 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
LRFN2Q9ULH4 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC24.29■■□□□ 1.48
LRFN2Q9ULH4 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
LRFN2Q9ULH4 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LRFN2Q9ULH4 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
LRFN2Q9ULH4 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
LRFN2Q9ULH4 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms