Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL63

MKLN1, Muskelin, humanhuman

Predictions only

Length 735 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKLN1Q9UL63 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
MKLN1Q9UL63 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
MKLN1Q9UL63 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
MKLN1Q9UL63 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
MKLN1Q9UL63 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
MKLN1Q9UL63 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
MKLN1Q9UL63 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
MKLN1Q9UL63 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
MKLN1Q9UL63 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
MKLN1Q9UL63 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
MKLN1Q9UL63 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
MKLN1Q9UL63 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
MKLN1Q9UL63 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
MKLN1Q9UL63 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
MKLN1Q9UL63 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
MKLN1Q9UL63 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
MKLN1Q9UL63 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
MKLN1Q9UL63 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
MKLN1Q9UL63 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
MKLN1Q9UL63 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
MKLN1Q9UL63 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
MKLN1Q9UL63 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
MKLN1Q9UL63 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
MKLN1Q9UL63 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
MKLN1Q9UL63 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
MKLN1Q9UL63 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
MKLN1Q9UL63 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
MKLN1Q9UL63 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC20.98■□□□□ 0.95
MKLN1Q9UL63 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
MKLN1Q9UL63 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
MKLN1Q9UL63 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC20.98■□□□□ 0.95
MKLN1Q9UL63 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC20.98■□□□□ 0.95
MKLN1Q9UL63 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
MKLN1Q9UL63 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
MKLN1Q9UL63 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
MKLN1Q9UL63 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
MKLN1Q9UL63 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
MKLN1Q9UL63 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
MKLN1Q9UL63 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
MKLN1Q9UL63 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
MKLN1Q9UL63 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
MKLN1Q9UL63 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
MKLN1Q9UL63 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
MKLN1Q9UL63 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
MKLN1Q9UL63 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
MKLN1Q9UL63 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
MKLN1Q9UL63 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
MKLN1Q9UL63 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
MKLN1Q9UL63 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
MKLN1Q9UL63 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
MKLN1Q9UL63 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
MKLN1Q9UL63 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC20.96■□□□□ 0.95
MKLN1Q9UL63 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
MKLN1Q9UL63 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
MKLN1Q9UL63 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
MKLN1Q9UL63 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
MKLN1Q9UL63 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
MKLN1Q9UL63 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
MKLN1Q9UL63 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
MKLN1Q9UL63 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
MKLN1Q9UL63 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
MKLN1Q9UL63 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
MKLN1Q9UL63 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
MKLN1Q9UL63 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
MKLN1Q9UL63 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
MKLN1Q9UL63 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
MKLN1Q9UL63 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
MKLN1Q9UL63 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
MKLN1Q9UL63 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
MKLN1Q9UL63 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
MKLN1Q9UL63 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
MKLN1Q9UL63 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
MKLN1Q9UL63 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
MKLN1Q9UL63 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
MKLN1Q9UL63 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
MKLN1Q9UL63 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC20.94■□□□□ 0.94
MKLN1Q9UL63 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
MKLN1Q9UL63 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
MKLN1Q9UL63 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
MKLN1Q9UL63 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
MKLN1Q9UL63 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
MKLN1Q9UL63 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
MKLN1Q9UL63 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
MKLN1Q9UL63 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
MKLN1Q9UL63 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
MKLN1Q9UL63 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
MKLN1Q9UL63 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
MKLN1Q9UL63 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
MKLN1Q9UL63 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
MKLN1Q9UL63 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
MKLN1Q9UL63 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
MKLN1Q9UL63 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
MKLN1Q9UL63 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
MKLN1Q9UL63 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
MKLN1Q9UL63 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
MKLN1Q9UL63 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
MKLN1Q9UL63 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
MKLN1Q9UL63 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
MKLN1Q9UL63 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
MKLN1Q9UL63 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms