Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKL4

GJD2, Gap junction delta-2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 321 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJD2Q9UKL4 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
GJD2Q9UKL4 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
GJD2Q9UKL4 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
GJD2Q9UKL4 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
GJD2Q9UKL4 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
GJD2Q9UKL4 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
GJD2Q9UKL4 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
GJD2Q9UKL4 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
GJD2Q9UKL4 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
GJD2Q9UKL4 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
GJD2Q9UKL4 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
GJD2Q9UKL4 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
GJD2Q9UKL4 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
GJD2Q9UKL4 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
GJD2Q9UKL4 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
GJD2Q9UKL4 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
GJD2Q9UKL4 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
GJD2Q9UKL4 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
GJD2Q9UKL4 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
GJD2Q9UKL4 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
GJD2Q9UKL4 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
GJD2Q9UKL4 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
GJD2Q9UKL4 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
GJD2Q9UKL4 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
GJD2Q9UKL4 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
GJD2Q9UKL4 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
GJD2Q9UKL4 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
GJD2Q9UKL4 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
GJD2Q9UKL4 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
GJD2Q9UKL4 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
GJD2Q9UKL4 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
GJD2Q9UKL4 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
GJD2Q9UKL4 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
GJD2Q9UKL4 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
GJD2Q9UKL4 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
GJD2Q9UKL4 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
GJD2Q9UKL4 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
GJD2Q9UKL4 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
GJD2Q9UKL4 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
GJD2Q9UKL4 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
GJD2Q9UKL4 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
GJD2Q9UKL4 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
GJD2Q9UKL4 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
GJD2Q9UKL4 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
GJD2Q9UKL4 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
GJD2Q9UKL4 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
GJD2Q9UKL4 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
GJD2Q9UKL4 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
GJD2Q9UKL4 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
GJD2Q9UKL4 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
GJD2Q9UKL4 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
GJD2Q9UKL4 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
GJD2Q9UKL4 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
GJD2Q9UKL4 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
GJD2Q9UKL4 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
GJD2Q9UKL4 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
GJD2Q9UKL4 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
GJD2Q9UKL4 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
GJD2Q9UKL4 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
GJD2Q9UKL4 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
GJD2Q9UKL4 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
GJD2Q9UKL4 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
GJD2Q9UKL4 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
GJD2Q9UKL4 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
GJD2Q9UKL4 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
GJD2Q9UKL4 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
GJD2Q9UKL4 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
GJD2Q9UKL4 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
GJD2Q9UKL4 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
GJD2Q9UKL4 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
GJD2Q9UKL4 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
GJD2Q9UKL4 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC25.66■■□□□ 1.7
GJD2Q9UKL4 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
GJD2Q9UKL4 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
GJD2Q9UKL4 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
GJD2Q9UKL4 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
GJD2Q9UKL4 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
GJD2Q9UKL4 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
GJD2Q9UKL4 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
GJD2Q9UKL4 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
GJD2Q9UKL4 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
GJD2Q9UKL4 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
GJD2Q9UKL4 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
GJD2Q9UKL4 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
GJD2Q9UKL4 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.7
GJD2Q9UKL4 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
GJD2Q9UKL4 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
GJD2Q9UKL4 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
GJD2Q9UKL4 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
GJD2Q9UKL4 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
GJD2Q9UKL4 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
GJD2Q9UKL4 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
GJD2Q9UKL4 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
GJD2Q9UKL4 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
GJD2Q9UKL4 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
GJD2Q9UKL4 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
GJD2Q9UKL4 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
GJD2Q9UKL4 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
GJD2Q9UKL4 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
GJD2Q9UKL4 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms