Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJK0

TSR3, Ribosome biogenesis protein TSR3 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSR3Q9UJK0 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TSR3Q9UJK0 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TSR3Q9UJK0 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TSR3Q9UJK0 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TSR3Q9UJK0 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TSR3Q9UJK0 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TSR3Q9UJK0 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TSR3Q9UJK0 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TSR3Q9UJK0 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TSR3Q9UJK0 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TSR3Q9UJK0 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
TSR3Q9UJK0 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TSR3Q9UJK0 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TSR3Q9UJK0 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TSR3Q9UJK0 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TSR3Q9UJK0 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TSR3Q9UJK0 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TSR3Q9UJK0 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TSR3Q9UJK0 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
TSR3Q9UJK0 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TSR3Q9UJK0 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
TSR3Q9UJK0 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TSR3Q9UJK0 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TSR3Q9UJK0 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TSR3Q9UJK0 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TSR3Q9UJK0 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TSR3Q9UJK0 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TSR3Q9UJK0 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TSR3Q9UJK0 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TSR3Q9UJK0 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TSR3Q9UJK0 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TSR3Q9UJK0 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TSR3Q9UJK0 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TSR3Q9UJK0 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TSR3Q9UJK0 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TSR3Q9UJK0 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TSR3Q9UJK0 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TSR3Q9UJK0 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TSR3Q9UJK0 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TSR3Q9UJK0 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TSR3Q9UJK0 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TSR3Q9UJK0 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TSR3Q9UJK0 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TSR3Q9UJK0 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TSR3Q9UJK0 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TSR3Q9UJK0 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TSR3Q9UJK0 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TSR3Q9UJK0 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TSR3Q9UJK0 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TSR3Q9UJK0 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TSR3Q9UJK0 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TSR3Q9UJK0 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TSR3Q9UJK0 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TSR3Q9UJK0 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
TSR3Q9UJK0 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TSR3Q9UJK0 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TSR3Q9UJK0 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TSR3Q9UJK0 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TSR3Q9UJK0 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
TSR3Q9UJK0 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TSR3Q9UJK0 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TSR3Q9UJK0 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TSR3Q9UJK0 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TSR3Q9UJK0 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TSR3Q9UJK0 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TSR3Q9UJK0 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TSR3Q9UJK0 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TSR3Q9UJK0 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TSR3Q9UJK0 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
TSR3Q9UJK0 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TSR3Q9UJK0 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
TSR3Q9UJK0 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TSR3Q9UJK0 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TSR3Q9UJK0 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TSR3Q9UJK0 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TSR3Q9UJK0 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TSR3Q9UJK0 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TSR3Q9UJK0 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TSR3Q9UJK0 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
TSR3Q9UJK0 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TSR3Q9UJK0 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TSR3Q9UJK0 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TSR3Q9UJK0 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TSR3Q9UJK0 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TSR3Q9UJK0 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TSR3Q9UJK0 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TSR3Q9UJK0 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TSR3Q9UJK0 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TSR3Q9UJK0 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
TSR3Q9UJK0 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TSR3Q9UJK0 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TSR3Q9UJK0 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TSR3Q9UJK0 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TSR3Q9UJK0 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
TSR3Q9UJK0 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
TSR3Q9UJK0 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TSR3Q9UJK0 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TSR3Q9UJK0 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TSR3Q9UJK0 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TSR3Q9UJK0 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms