Protein–RNA interactions for Protein: Q9UII6

DUSP13, Dual specificity protein phosphatase 13 isoform B, humanhuman

Predictions only

Length 198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP13Q9UII6 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
DUSP13Q9UII6 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
DUSP13Q9UII6 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
DUSP13Q9UII6 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
DUSP13Q9UII6 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
DUSP13Q9UII6 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
DUSP13Q9UII6 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
DUSP13Q9UII6 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
DUSP13Q9UII6 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
DUSP13Q9UII6 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
DUSP13Q9UII6 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
DUSP13Q9UII6 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
DUSP13Q9UII6 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
DUSP13Q9UII6 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
DUSP13Q9UII6 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
DUSP13Q9UII6 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
DUSP13Q9UII6 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
DUSP13Q9UII6 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
DUSP13Q9UII6 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
DUSP13Q9UII6 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
DUSP13Q9UII6 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
DUSP13Q9UII6 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
DUSP13Q9UII6 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC19.33■□□□□ 0.68
DUSP13Q9UII6 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
DUSP13Q9UII6 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
DUSP13Q9UII6 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
DUSP13Q9UII6 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
DUSP13Q9UII6 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
DUSP13Q9UII6 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
DUSP13Q9UII6 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
DUSP13Q9UII6 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
DUSP13Q9UII6 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
DUSP13Q9UII6 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
DUSP13Q9UII6 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
DUSP13Q9UII6 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
DUSP13Q9UII6 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
DUSP13Q9UII6 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
DUSP13Q9UII6 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
DUSP13Q9UII6 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
DUSP13Q9UII6 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
DUSP13Q9UII6 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
DUSP13Q9UII6 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
DUSP13Q9UII6 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
DUSP13Q9UII6 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
DUSP13Q9UII6 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
DUSP13Q9UII6 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
DUSP13Q9UII6 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
DUSP13Q9UII6 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
DUSP13Q9UII6 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
DUSP13Q9UII6 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
DUSP13Q9UII6 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
DUSP13Q9UII6 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
DUSP13Q9UII6 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
DUSP13Q9UII6 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
DUSP13Q9UII6 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
DUSP13Q9UII6 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
DUSP13Q9UII6 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
DUSP13Q9UII6 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
DUSP13Q9UII6 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
DUSP13Q9UII6 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
DUSP13Q9UII6 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
DUSP13Q9UII6 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
DUSP13Q9UII6 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
DUSP13Q9UII6 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
DUSP13Q9UII6 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
DUSP13Q9UII6 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
DUSP13Q9UII6 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
DUSP13Q9UII6 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
DUSP13Q9UII6 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
DUSP13Q9UII6 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
DUSP13Q9UII6 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
DUSP13Q9UII6 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
DUSP13Q9UII6 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
DUSP13Q9UII6 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
DUSP13Q9UII6 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
DUSP13Q9UII6 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
DUSP13Q9UII6 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
DUSP13Q9UII6 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
DUSP13Q9UII6 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
DUSP13Q9UII6 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
DUSP13Q9UII6 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
DUSP13Q9UII6 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
DUSP13Q9UII6 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
DUSP13Q9UII6 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
DUSP13Q9UII6 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
DUSP13Q9UII6 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
DUSP13Q9UII6 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
DUSP13Q9UII6 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
DUSP13Q9UII6 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
DUSP13Q9UII6 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
DUSP13Q9UII6 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
DUSP13Q9UII6 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
DUSP13Q9UII6 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
DUSP13Q9UII6 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
DUSP13Q9UII6 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
DUSP13Q9UII6 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
DUSP13Q9UII6 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
DUSP13Q9UII6 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
DUSP13Q9UII6 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
DUSP13Q9UII6 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.3 ms