Protein–RNA interactions for Protein: Q9UII4

HERC5, E3 ISG15--protein ligase HERC5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,024 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC5Q9UII4 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
HERC5Q9UII4 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
HERC5Q9UII4 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
HERC5Q9UII4 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
HERC5Q9UII4 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
HERC5Q9UII4 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
HERC5Q9UII4 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
HERC5Q9UII4 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
HERC5Q9UII4 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC26.54■■□□□ 1.84
HERC5Q9UII4 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
HERC5Q9UII4 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
HERC5Q9UII4 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
HERC5Q9UII4 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
HERC5Q9UII4 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
HERC5Q9UII4 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
HERC5Q9UII4 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
HERC5Q9UII4 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
HERC5Q9UII4 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
HERC5Q9UII4 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
HERC5Q9UII4 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
HERC5Q9UII4 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC26.52■■□□□ 1.84
HERC5Q9UII4 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
HERC5Q9UII4 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
HERC5Q9UII4 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
HERC5Q9UII4 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
HERC5Q9UII4 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
HERC5Q9UII4 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
HERC5Q9UII4 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
HERC5Q9UII4 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
HERC5Q9UII4 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
HERC5Q9UII4 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
HERC5Q9UII4 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
HERC5Q9UII4 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
HERC5Q9UII4 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
HERC5Q9UII4 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
HERC5Q9UII4 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
HERC5Q9UII4 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
HERC5Q9UII4 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
HERC5Q9UII4 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
HERC5Q9UII4 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
HERC5Q9UII4 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
HERC5Q9UII4 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
HERC5Q9UII4 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
HERC5Q9UII4 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
HERC5Q9UII4 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
HERC5Q9UII4 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC26.5■■□□□ 1.83
HERC5Q9UII4 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
HERC5Q9UII4 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
HERC5Q9UII4 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
HERC5Q9UII4 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
HERC5Q9UII4 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
HERC5Q9UII4 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC26.5■■□□□ 1.83
HERC5Q9UII4 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
HERC5Q9UII4 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC26.5■■□□□ 1.83
HERC5Q9UII4 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
HERC5Q9UII4 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
HERC5Q9UII4 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
HERC5Q9UII4 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
HERC5Q9UII4 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
HERC5Q9UII4 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
HERC5Q9UII4 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
HERC5Q9UII4 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC26.49■■□□□ 1.83
HERC5Q9UII4 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
HERC5Q9UII4 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
HERC5Q9UII4 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
HERC5Q9UII4 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
HERC5Q9UII4 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
HERC5Q9UII4 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
HERC5Q9UII4 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
HERC5Q9UII4 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
HERC5Q9UII4 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
HERC5Q9UII4 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
HERC5Q9UII4 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
HERC5Q9UII4 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
HERC5Q9UII4 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
HERC5Q9UII4 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
HERC5Q9UII4 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
HERC5Q9UII4 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
HERC5Q9UII4 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
HERC5Q9UII4 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
HERC5Q9UII4 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
HERC5Q9UII4 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
HERC5Q9UII4 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
HERC5Q9UII4 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
HERC5Q9UII4 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
HERC5Q9UII4 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
HERC5Q9UII4 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
HERC5Q9UII4 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
HERC5Q9UII4 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
HERC5Q9UII4 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
HERC5Q9UII4 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
HERC5Q9UII4 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
HERC5Q9UII4 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
HERC5Q9UII4 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
HERC5Q9UII4 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
HERC5Q9UII4 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
HERC5Q9UII4 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
HERC5Q9UII4 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
HERC5Q9UII4 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
HERC5Q9UII4 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms