Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHW5

GPN3, GPN-loop GTPase 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPN3Q9UHW5 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GPN3Q9UHW5 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
GPN3Q9UHW5 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GPN3Q9UHW5 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GPN3Q9UHW5 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GPN3Q9UHW5 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GPN3Q9UHW5 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GPN3Q9UHW5 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GPN3Q9UHW5 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
GPN3Q9UHW5 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
GPN3Q9UHW5 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GPN3Q9UHW5 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GPN3Q9UHW5 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GPN3Q9UHW5 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GPN3Q9UHW5 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GPN3Q9UHW5 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GPN3Q9UHW5 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GPN3Q9UHW5 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GPN3Q9UHW5 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GPN3Q9UHW5 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GPN3Q9UHW5 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GPN3Q9UHW5 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
GPN3Q9UHW5 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
GPN3Q9UHW5 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GPN3Q9UHW5 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GPN3Q9UHW5 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GPN3Q9UHW5 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GPN3Q9UHW5 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GPN3Q9UHW5 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GPN3Q9UHW5 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GPN3Q9UHW5 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GPN3Q9UHW5 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GPN3Q9UHW5 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
GPN3Q9UHW5 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GPN3Q9UHW5 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
GPN3Q9UHW5 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
GPN3Q9UHW5 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
GPN3Q9UHW5 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GPN3Q9UHW5 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GPN3Q9UHW5 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GPN3Q9UHW5 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
GPN3Q9UHW5 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GPN3Q9UHW5 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GPN3Q9UHW5 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GPN3Q9UHW5 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GPN3Q9UHW5 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GPN3Q9UHW5 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GPN3Q9UHW5 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
GPN3Q9UHW5 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GPN3Q9UHW5 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GPN3Q9UHW5 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GPN3Q9UHW5 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GPN3Q9UHW5 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
GPN3Q9UHW5 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
GPN3Q9UHW5 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GPN3Q9UHW5 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GPN3Q9UHW5 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
GPN3Q9UHW5 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GPN3Q9UHW5 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GPN3Q9UHW5 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GPN3Q9UHW5 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
GPN3Q9UHW5 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GPN3Q9UHW5 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
GPN3Q9UHW5 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
GPN3Q9UHW5 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
GPN3Q9UHW5 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
GPN3Q9UHW5 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
GPN3Q9UHW5 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
GPN3Q9UHW5 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GPN3Q9UHW5 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
GPN3Q9UHW5 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
GPN3Q9UHW5 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
GPN3Q9UHW5 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GPN3Q9UHW5 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GPN3Q9UHW5 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GPN3Q9UHW5 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
GPN3Q9UHW5 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GPN3Q9UHW5 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GPN3Q9UHW5 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GPN3Q9UHW5 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
GPN3Q9UHW5 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
GPN3Q9UHW5 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GPN3Q9UHW5 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GPN3Q9UHW5 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GPN3Q9UHW5 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GPN3Q9UHW5 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GPN3Q9UHW5 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GPN3Q9UHW5 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GPN3Q9UHW5 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GPN3Q9UHW5 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GPN3Q9UHW5 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
GPN3Q9UHW5 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
GPN3Q9UHW5 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
GPN3Q9UHW5 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
GPN3Q9UHW5 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
GPN3Q9UHW5 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
GPN3Q9UHW5 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
GPN3Q9UHW5 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
GPN3Q9UHW5 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
GPN3Q9UHW5 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14 ms