Protein–RNA interactions for Protein: Q9UH77

KLHL3, Kelch-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 587 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL3Q9UH77 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
KLHL3Q9UH77 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
KLHL3Q9UH77 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
KLHL3Q9UH77 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
KLHL3Q9UH77 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
KLHL3Q9UH77 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
KLHL3Q9UH77 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
KLHL3Q9UH77 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
KLHL3Q9UH77 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
KLHL3Q9UH77 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
KLHL3Q9UH77 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
KLHL3Q9UH77 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
KLHL3Q9UH77 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
KLHL3Q9UH77 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
KLHL3Q9UH77 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
KLHL3Q9UH77 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
KLHL3Q9UH77 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
KLHL3Q9UH77 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
KLHL3Q9UH77 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
KLHL3Q9UH77 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
KLHL3Q9UH77 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
KLHL3Q9UH77 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
KLHL3Q9UH77 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
KLHL3Q9UH77 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
KLHL3Q9UH77 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
KLHL3Q9UH77 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
KLHL3Q9UH77 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
KLHL3Q9UH77 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
KLHL3Q9UH77 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
KLHL3Q9UH77 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
KLHL3Q9UH77 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
KLHL3Q9UH77 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
KLHL3Q9UH77 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
KLHL3Q9UH77 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
KLHL3Q9UH77 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
KLHL3Q9UH77 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
KLHL3Q9UH77 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
KLHL3Q9UH77 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
KLHL3Q9UH77 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
KLHL3Q9UH77 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
KLHL3Q9UH77 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
KLHL3Q9UH77 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
KLHL3Q9UH77 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
KLHL3Q9UH77 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
KLHL3Q9UH77 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
KLHL3Q9UH77 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
KLHL3Q9UH77 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
KLHL3Q9UH77 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
KLHL3Q9UH77 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
KLHL3Q9UH77 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
KLHL3Q9UH77 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
KLHL3Q9UH77 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
KLHL3Q9UH77 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
KLHL3Q9UH77 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
KLHL3Q9UH77 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
KLHL3Q9UH77 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
KLHL3Q9UH77 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
KLHL3Q9UH77 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
KLHL3Q9UH77 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
KLHL3Q9UH77 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
KLHL3Q9UH77 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
KLHL3Q9UH77 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
KLHL3Q9UH77 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
KLHL3Q9UH77 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
KLHL3Q9UH77 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
KLHL3Q9UH77 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
KLHL3Q9UH77 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
KLHL3Q9UH77 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
KLHL3Q9UH77 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
KLHL3Q9UH77 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
KLHL3Q9UH77 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
KLHL3Q9UH77 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
KLHL3Q9UH77 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
KLHL3Q9UH77 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
KLHL3Q9UH77 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
KLHL3Q9UH77 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
KLHL3Q9UH77 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
KLHL3Q9UH77 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
KLHL3Q9UH77 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
KLHL3Q9UH77 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
KLHL3Q9UH77 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
KLHL3Q9UH77 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
KLHL3Q9UH77 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
KLHL3Q9UH77 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
KLHL3Q9UH77 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
KLHL3Q9UH77 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
KLHL3Q9UH77 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
KLHL3Q9UH77 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
KLHL3Q9UH77 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
KLHL3Q9UH77 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
KLHL3Q9UH77 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
KLHL3Q9UH77 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
KLHL3Q9UH77 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
KLHL3Q9UH77 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
KLHL3Q9UH77 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
KLHL3Q9UH77 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
KLHL3Q9UH77 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC21.82■■□□□ 1.08
KLHL3Q9UH77 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
KLHL3Q9UH77 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
KLHL3Q9UH77 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 149.5 ms