Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBY8

CLN8, Protein CLN8, humanhuman

Predictions only

Length 286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN8Q9UBY8 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CLN8Q9UBY8 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CLN8Q9UBY8 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CLN8Q9UBY8 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CLN8Q9UBY8 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CLN8Q9UBY8 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
CLN8Q9UBY8 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CLN8Q9UBY8 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CLN8Q9UBY8 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CLN8Q9UBY8 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CLN8Q9UBY8 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CLN8Q9UBY8 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CLN8Q9UBY8 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CLN8Q9UBY8 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CLN8Q9UBY8 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CLN8Q9UBY8 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CLN8Q9UBY8 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CLN8Q9UBY8 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CLN8Q9UBY8 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CLN8Q9UBY8 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CLN8Q9UBY8 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CLN8Q9UBY8 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CLN8Q9UBY8 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CLN8Q9UBY8 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CLN8Q9UBY8 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CLN8Q9UBY8 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CLN8Q9UBY8 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CLN8Q9UBY8 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CLN8Q9UBY8 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CLN8Q9UBY8 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CLN8Q9UBY8 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CLN8Q9UBY8 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CLN8Q9UBY8 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CLN8Q9UBY8 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CLN8Q9UBY8 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CLN8Q9UBY8 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
CLN8Q9UBY8 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CLN8Q9UBY8 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
CLN8Q9UBY8 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CLN8Q9UBY8 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CLN8Q9UBY8 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
CLN8Q9UBY8 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CLN8Q9UBY8 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CLN8Q9UBY8 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.62
CLN8Q9UBY8 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
CLN8Q9UBY8 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.62
CLN8Q9UBY8 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
CLN8Q9UBY8 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CLN8Q9UBY8 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CLN8Q9UBY8 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CLN8Q9UBY8 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CLN8Q9UBY8 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CLN8Q9UBY8 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CLN8Q9UBY8 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CLN8Q9UBY8 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CLN8Q9UBY8 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CLN8Q9UBY8 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CLN8Q9UBY8 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CLN8Q9UBY8 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CLN8Q9UBY8 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CLN8Q9UBY8 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CLN8Q9UBY8 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CLN8Q9UBY8 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CLN8Q9UBY8 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CLN8Q9UBY8 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CLN8Q9UBY8 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CLN8Q9UBY8 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CLN8Q9UBY8 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CLN8Q9UBY8 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
CLN8Q9UBY8 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CLN8Q9UBY8 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CLN8Q9UBY8 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CLN8Q9UBY8 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CLN8Q9UBY8 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CLN8Q9UBY8 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CLN8Q9UBY8 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CLN8Q9UBY8 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CLN8Q9UBY8 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CLN8Q9UBY8 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CLN8Q9UBY8 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CLN8Q9UBY8 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CLN8Q9UBY8 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CLN8Q9UBY8 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
CLN8Q9UBY8 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CLN8Q9UBY8 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CLN8Q9UBY8 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
CLN8Q9UBY8 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CLN8Q9UBY8 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CLN8Q9UBY8 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CLN8Q9UBY8 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CLN8Q9UBY8 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CLN8Q9UBY8 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CLN8Q9UBY8 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CLN8Q9UBY8 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CLN8Q9UBY8 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CLN8Q9UBY8 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CLN8Q9UBY8 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CLN8Q9UBY8 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CLN8Q9UBY8 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CLN8Q9UBY8 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.7 ms