Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBE0

SAE1, SUMO-activating enzyme subunit 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAE1Q9UBE0 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SAE1Q9UBE0 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
SAE1Q9UBE0 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SAE1Q9UBE0 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SAE1Q9UBE0 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SAE1Q9UBE0 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SAE1Q9UBE0 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SAE1Q9UBE0 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SAE1Q9UBE0 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SAE1Q9UBE0 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SAE1Q9UBE0 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SAE1Q9UBE0 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SAE1Q9UBE0 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SAE1Q9UBE0 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SAE1Q9UBE0 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SAE1Q9UBE0 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SAE1Q9UBE0 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SAE1Q9UBE0 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SAE1Q9UBE0 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.31
SAE1Q9UBE0 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.31
SAE1Q9UBE0 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.31
SAE1Q9UBE0 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
SAE1Q9UBE0 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SAE1Q9UBE0 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SAE1Q9UBE0 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SAE1Q9UBE0 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SAE1Q9UBE0 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SAE1Q9UBE0 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SAE1Q9UBE0 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SAE1Q9UBE0 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SAE1Q9UBE0 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SAE1Q9UBE0 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SAE1Q9UBE0 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SAE1Q9UBE0 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SAE1Q9UBE0 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SAE1Q9UBE0 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SAE1Q9UBE0 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SAE1Q9UBE0 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SAE1Q9UBE0 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SAE1Q9UBE0 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SAE1Q9UBE0 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
SAE1Q9UBE0 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SAE1Q9UBE0 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SAE1Q9UBE0 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SAE1Q9UBE0 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SAE1Q9UBE0 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SAE1Q9UBE0 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SAE1Q9UBE0 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SAE1Q9UBE0 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SAE1Q9UBE0 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SAE1Q9UBE0 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SAE1Q9UBE0 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SAE1Q9UBE0 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SAE1Q9UBE0 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SAE1Q9UBE0 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SAE1Q9UBE0 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SAE1Q9UBE0 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SAE1Q9UBE0 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SAE1Q9UBE0 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SAE1Q9UBE0 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SAE1Q9UBE0 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SAE1Q9UBE0 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SAE1Q9UBE0 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SAE1Q9UBE0 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SAE1Q9UBE0 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SAE1Q9UBE0 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SAE1Q9UBE0 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SAE1Q9UBE0 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SAE1Q9UBE0 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SAE1Q9UBE0 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SAE1Q9UBE0 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SAE1Q9UBE0 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SAE1Q9UBE0 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SAE1Q9UBE0 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SAE1Q9UBE0 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SAE1Q9UBE0 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SAE1Q9UBE0 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SAE1Q9UBE0 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SAE1Q9UBE0 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SAE1Q9UBE0 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SAE1Q9UBE0 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SAE1Q9UBE0 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SAE1Q9UBE0 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SAE1Q9UBE0 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SAE1Q9UBE0 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SAE1Q9UBE0 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SAE1Q9UBE0 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
SAE1Q9UBE0 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SAE1Q9UBE0 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SAE1Q9UBE0 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
SAE1Q9UBE0 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SAE1Q9UBE0 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SAE1Q9UBE0 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SAE1Q9UBE0 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SAE1Q9UBE0 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SAE1Q9UBE0 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SAE1Q9UBE0 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SAE1Q9UBE0 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SAE1Q9UBE0 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
SAE1Q9UBE0 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms