Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2R6

RERE, Arginine-glutamic acid dipeptide repeats protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,566 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
REREQ9P2R6 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
REREQ9P2R6 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC33.78■■■■□ 3
REREQ9P2R6 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC33.77■■■■□ 3
REREQ9P2R6 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC33.77■■■■□ 3
REREQ9P2R6 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC33.77■■■■□ 3
REREQ9P2R6 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
REREQ9P2R6 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC33.77■■■■□ 3
REREQ9P2R6 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC33.77■■■■□ 3
REREQ9P2R6 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC33.77■■■■□ 3
REREQ9P2R6 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.76■■■□□ 2.99
REREQ9P2R6 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
REREQ9P2R6 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC33.76■■■□□ 2.99
REREQ9P2R6 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC33.76■■■□□ 2.99
REREQ9P2R6 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
REREQ9P2R6 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
REREQ9P2R6 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC33.76■■■□□ 2.99
REREQ9P2R6 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
REREQ9P2R6 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC33.76■■■□□ 2.99
REREQ9P2R6 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC33.75■■■□□ 2.99
REREQ9P2R6 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
REREQ9P2R6 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
REREQ9P2R6 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.75■■■□□ 2.99
REREQ9P2R6 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.75■■■□□ 2.99
REREQ9P2R6 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC33.75■■■□□ 2.99
REREQ9P2R6 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
REREQ9P2R6 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
REREQ9P2R6 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC33.74■■■□□ 2.99
REREQ9P2R6 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC33.74■■■□□ 2.99
REREQ9P2R6 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC33.74■■■□□ 2.99
REREQ9P2R6 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
REREQ9P2R6 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
REREQ9P2R6 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
REREQ9P2R6 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.73■■■□□ 2.99
REREQ9P2R6 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC33.73■■■□□ 2.99
REREQ9P2R6 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC33.73■■■□□ 2.99
REREQ9P2R6 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC33.73■■■□□ 2.99
REREQ9P2R6 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
REREQ9P2R6 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC33.73■■■□□ 2.99
REREQ9P2R6 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
REREQ9P2R6 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC33.72■■■□□ 2.99
REREQ9P2R6 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC33.72■■■□□ 2.99
REREQ9P2R6 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.72■■■□□ 2.99
REREQ9P2R6 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
REREQ9P2R6 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
REREQ9P2R6 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC33.72■■■□□ 2.99
REREQ9P2R6 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC33.72■■■□□ 2.99
REREQ9P2R6 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC33.72■■■□□ 2.99
REREQ9P2R6 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC33.72■■■□□ 2.99
REREQ9P2R6 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC33.72■■■□□ 2.99
REREQ9P2R6 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
REREQ9P2R6 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
REREQ9P2R6 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC33.72■■■□□ 2.99
REREQ9P2R6 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC33.72■■■□□ 2.99
REREQ9P2R6 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
REREQ9P2R6 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC33.71■■■□□ 2.99
REREQ9P2R6 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
REREQ9P2R6 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC33.71■■■□□ 2.99
REREQ9P2R6 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC33.71■■■□□ 2.99
REREQ9P2R6 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
REREQ9P2R6 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
REREQ9P2R6 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC33.71■■■□□ 2.99
REREQ9P2R6 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
REREQ9P2R6 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.7■■■□□ 2.99
REREQ9P2R6 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.7■■■□□ 2.99
REREQ9P2R6 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC33.7■■■□□ 2.99
REREQ9P2R6 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC33.7■■■□□ 2.99
REREQ9P2R6 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC33.7■■■□□ 2.99
REREQ9P2R6 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC33.7■■■□□ 2.99
REREQ9P2R6 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC33.7■■■□□ 2.99
REREQ9P2R6 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC33.7■■■□□ 2.98
REREQ9P2R6 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.98
REREQ9P2R6 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC33.7■■■□□ 2.98
REREQ9P2R6 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC33.69■■■□□ 2.98
REREQ9P2R6 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC33.69■■■□□ 2.98
REREQ9P2R6 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC33.69■■■□□ 2.98
REREQ9P2R6 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC33.69■■■□□ 2.98
REREQ9P2R6 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC33.69■■■□□ 2.98
REREQ9P2R6 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC33.69■■■□□ 2.98
REREQ9P2R6 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
REREQ9P2R6 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.68■■■□□ 2.98
REREQ9P2R6 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
REREQ9P2R6 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC33.68■■■□□ 2.98
REREQ9P2R6 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC33.68■■■□□ 2.98
REREQ9P2R6 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
REREQ9P2R6 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC33.68■■■□□ 2.98
REREQ9P2R6 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
REREQ9P2R6 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.68■■■□□ 2.98
REREQ9P2R6 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC33.68■■■□□ 2.98
REREQ9P2R6 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC33.68■■■□□ 2.98
REREQ9P2R6 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
REREQ9P2R6 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
REREQ9P2R6 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.67■■■□□ 2.98
REREQ9P2R6 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.67■■■□□ 2.98
REREQ9P2R6 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC33.67■■■□□ 2.98
REREQ9P2R6 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC33.67■■■□□ 2.98
REREQ9P2R6 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.66■■■□□ 2.98
REREQ9P2R6 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC33.66■■■□□ 2.98
REREQ9P2R6 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
REREQ9P2R6 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC33.66■■■□□ 2.98
REREQ9P2R6 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC33.66■■■□□ 2.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 105.4 ms