Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2J2

IGSF9, Protein turtle homolog A, humanhuman

Predictions only

Length 1,179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGSF9Q9P2J2 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
IGSF9Q9P2J2 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
IGSF9Q9P2J2 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
IGSF9Q9P2J2 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
IGSF9Q9P2J2 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
IGSF9Q9P2J2 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
IGSF9Q9P2J2 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
IGSF9Q9P2J2 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
IGSF9Q9P2J2 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
IGSF9Q9P2J2 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
IGSF9Q9P2J2 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
IGSF9Q9P2J2 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
IGSF9Q9P2J2 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
IGSF9Q9P2J2 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
IGSF9Q9P2J2 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
IGSF9Q9P2J2 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
IGSF9Q9P2J2 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
IGSF9Q9P2J2 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
IGSF9Q9P2J2 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
IGSF9Q9P2J2 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
IGSF9Q9P2J2 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
IGSF9Q9P2J2 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
IGSF9Q9P2J2 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
IGSF9Q9P2J2 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
IGSF9Q9P2J2 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
IGSF9Q9P2J2 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
IGSF9Q9P2J2 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
IGSF9Q9P2J2 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
IGSF9Q9P2J2 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
IGSF9Q9P2J2 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
IGSF9Q9P2J2 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
IGSF9Q9P2J2 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
IGSF9Q9P2J2 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
IGSF9Q9P2J2 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
IGSF9Q9P2J2 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
IGSF9Q9P2J2 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
IGSF9Q9P2J2 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
IGSF9Q9P2J2 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
IGSF9Q9P2J2 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
IGSF9Q9P2J2 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
IGSF9Q9P2J2 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
IGSF9Q9P2J2 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
IGSF9Q9P2J2 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
IGSF9Q9P2J2 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC23.73■■□□□ 1.39
IGSF9Q9P2J2 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
IGSF9Q9P2J2 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
IGSF9Q9P2J2 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
IGSF9Q9P2J2 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
IGSF9Q9P2J2 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
IGSF9Q9P2J2 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
IGSF9Q9P2J2 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
IGSF9Q9P2J2 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
IGSF9Q9P2J2 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
IGSF9Q9P2J2 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
IGSF9Q9P2J2 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
IGSF9Q9P2J2 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
IGSF9Q9P2J2 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
IGSF9Q9P2J2 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
IGSF9Q9P2J2 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
IGSF9Q9P2J2 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
IGSF9Q9P2J2 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
IGSF9Q9P2J2 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
IGSF9Q9P2J2 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
IGSF9Q9P2J2 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
IGSF9Q9P2J2 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
IGSF9Q9P2J2 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
IGSF9Q9P2J2 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
IGSF9Q9P2J2 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
IGSF9Q9P2J2 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
IGSF9Q9P2J2 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
IGSF9Q9P2J2 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
IGSF9Q9P2J2 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
IGSF9Q9P2J2 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
IGSF9Q9P2J2 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
IGSF9Q9P2J2 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
IGSF9Q9P2J2 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
IGSF9Q9P2J2 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
IGSF9Q9P2J2 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
IGSF9Q9P2J2 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
IGSF9Q9P2J2 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
IGSF9Q9P2J2 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
IGSF9Q9P2J2 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
IGSF9Q9P2J2 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
IGSF9Q9P2J2 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
IGSF9Q9P2J2 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC23.69■■□□□ 1.38
IGSF9Q9P2J2 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC23.69■■□□□ 1.38
IGSF9Q9P2J2 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
IGSF9Q9P2J2 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
IGSF9Q9P2J2 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
IGSF9Q9P2J2 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
IGSF9Q9P2J2 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
IGSF9Q9P2J2 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
IGSF9Q9P2J2 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
IGSF9Q9P2J2 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
IGSF9Q9P2J2 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
IGSF9Q9P2J2 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
IGSF9Q9P2J2 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC23.68■■□□□ 1.38
IGSF9Q9P2J2 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
IGSF9Q9P2J2 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
IGSF9Q9P2J2 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms