Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2I0

CPSF2, Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 782 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPSF2Q9P2I0 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CPSF2Q9P2I0 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CPSF2Q9P2I0 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CPSF2Q9P2I0 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CPSF2Q9P2I0 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CPSF2Q9P2I0 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CPSF2Q9P2I0 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CPSF2Q9P2I0 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CPSF2Q9P2I0 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CPSF2Q9P2I0 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CPSF2Q9P2I0 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CPSF2Q9P2I0 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CPSF2Q9P2I0 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CPSF2Q9P2I0 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CPSF2Q9P2I0 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CPSF2Q9P2I0 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CPSF2Q9P2I0 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CPSF2Q9P2I0 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CPSF2Q9P2I0 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CPSF2Q9P2I0 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CPSF2Q9P2I0 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CPSF2Q9P2I0 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CPSF2Q9P2I0 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CPSF2Q9P2I0 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CPSF2Q9P2I0 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CPSF2Q9P2I0 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
CPSF2Q9P2I0 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CPSF2Q9P2I0 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CPSF2Q9P2I0 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CPSF2Q9P2I0 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CPSF2Q9P2I0 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CPSF2Q9P2I0 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CPSF2Q9P2I0 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CPSF2Q9P2I0 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CPSF2Q9P2I0 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CPSF2Q9P2I0 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CPSF2Q9P2I0 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CPSF2Q9P2I0 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CPSF2Q9P2I0 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CPSF2Q9P2I0 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CPSF2Q9P2I0 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CPSF2Q9P2I0 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CPSF2Q9P2I0 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CPSF2Q9P2I0 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
CPSF2Q9P2I0 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CPSF2Q9P2I0 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CPSF2Q9P2I0 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
CPSF2Q9P2I0 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CPSF2Q9P2I0 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
CPSF2Q9P2I0 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
CPSF2Q9P2I0 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CPSF2Q9P2I0 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CPSF2Q9P2I0 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CPSF2Q9P2I0 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CPSF2Q9P2I0 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CPSF2Q9P2I0 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CPSF2Q9P2I0 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CPSF2Q9P2I0 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CPSF2Q9P2I0 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CPSF2Q9P2I0 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CPSF2Q9P2I0 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CPSF2Q9P2I0 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CPSF2Q9P2I0 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CPSF2Q9P2I0 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CPSF2Q9P2I0 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CPSF2Q9P2I0 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CPSF2Q9P2I0 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CPSF2Q9P2I0 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CPSF2Q9P2I0 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CPSF2Q9P2I0 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CPSF2Q9P2I0 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CPSF2Q9P2I0 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CPSF2Q9P2I0 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CPSF2Q9P2I0 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CPSF2Q9P2I0 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CPSF2Q9P2I0 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CPSF2Q9P2I0 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CPSF2Q9P2I0 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CPSF2Q9P2I0 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CPSF2Q9P2I0 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CPSF2Q9P2I0 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CPSF2Q9P2I0 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CPSF2Q9P2I0 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CPSF2Q9P2I0 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CPSF2Q9P2I0 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CPSF2Q9P2I0 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CPSF2Q9P2I0 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CPSF2Q9P2I0 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CPSF2Q9P2I0 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CPSF2Q9P2I0 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CPSF2Q9P2I0 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CPSF2Q9P2I0 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CPSF2Q9P2I0 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CPSF2Q9P2I0 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CPSF2Q9P2I0 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CPSF2Q9P2I0 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CPSF2Q9P2I0 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CPSF2Q9P2I0 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CPSF2Q9P2I0 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CPSF2Q9P2I0 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms