Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Z2

CALCOCO1, Calcium-binding and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALCOCO1Q9P1Z2 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CALCOCO1Q9P1Z2 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CALCOCO1Q9P1Z2 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CALCOCO1Q9P1Z2 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CALCOCO1Q9P1Z2 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CALCOCO1Q9P1Z2 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
CALCOCO1Q9P1Z2 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CALCOCO1Q9P1Z2 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CALCOCO1Q9P1Z2 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CALCOCO1Q9P1Z2 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CALCOCO1Q9P1Z2 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CALCOCO1Q9P1Z2 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CALCOCO1Q9P1Z2 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CALCOCO1Q9P1Z2 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CALCOCO1Q9P1Z2 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CALCOCO1Q9P1Z2 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CALCOCO1Q9P1Z2 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CALCOCO1Q9P1Z2 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CALCOCO1Q9P1Z2 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CALCOCO1Q9P1Z2 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CALCOCO1Q9P1Z2 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CALCOCO1Q9P1Z2 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CALCOCO1Q9P1Z2 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CALCOCO1Q9P1Z2 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CALCOCO1Q9P1Z2 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CALCOCO1Q9P1Z2 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CALCOCO1Q9P1Z2 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CALCOCO1Q9P1Z2 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CALCOCO1Q9P1Z2 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CALCOCO1Q9P1Z2 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CALCOCO1Q9P1Z2 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CALCOCO1Q9P1Z2 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CALCOCO1Q9P1Z2 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CALCOCO1Q9P1Z2 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CALCOCO1Q9P1Z2 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CALCOCO1Q9P1Z2 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CALCOCO1Q9P1Z2 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
CALCOCO1Q9P1Z2 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CALCOCO1Q9P1Z2 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CALCOCO1Q9P1Z2 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CALCOCO1Q9P1Z2 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
CALCOCO1Q9P1Z2 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CALCOCO1Q9P1Z2 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CALCOCO1Q9P1Z2 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CALCOCO1Q9P1Z2 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CALCOCO1Q9P1Z2 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CALCOCO1Q9P1Z2 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CALCOCO1Q9P1Z2 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CALCOCO1Q9P1Z2 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CALCOCO1Q9P1Z2 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CALCOCO1Q9P1Z2 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CALCOCO1Q9P1Z2 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CALCOCO1Q9P1Z2 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CALCOCO1Q9P1Z2 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CALCOCO1Q9P1Z2 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
CALCOCO1Q9P1Z2 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CALCOCO1Q9P1Z2 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CALCOCO1Q9P1Z2 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CALCOCO1Q9P1Z2 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CALCOCO1Q9P1Z2 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CALCOCO1Q9P1Z2 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CALCOCO1Q9P1Z2 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CALCOCO1Q9P1Z2 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CALCOCO1Q9P1Z2 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CALCOCO1Q9P1Z2 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CALCOCO1Q9P1Z2 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CALCOCO1Q9P1Z2 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CALCOCO1Q9P1Z2 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CALCOCO1Q9P1Z2 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
CALCOCO1Q9P1Z2 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CALCOCO1Q9P1Z2 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CALCOCO1Q9P1Z2 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CALCOCO1Q9P1Z2 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
CALCOCO1Q9P1Z2 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
CALCOCO1Q9P1Z2 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CALCOCO1Q9P1Z2 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CALCOCO1Q9P1Z2 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CALCOCO1Q9P1Z2 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CALCOCO1Q9P1Z2 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
CALCOCO1Q9P1Z2 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
CALCOCO1Q9P1Z2 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CALCOCO1Q9P1Z2 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CALCOCO1Q9P1Z2 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CALCOCO1Q9P1Z2 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CALCOCO1Q9P1Z2 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CALCOCO1Q9P1Z2 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CALCOCO1Q9P1Z2 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CALCOCO1Q9P1Z2 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CALCOCO1Q9P1Z2 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CALCOCO1Q9P1Z2 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CALCOCO1Q9P1Z2 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CALCOCO1Q9P1Z2 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CALCOCO1Q9P1Z2 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CALCOCO1Q9P1Z2 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CALCOCO1Q9P1Z2 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CALCOCO1Q9P1Z2 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CALCOCO1Q9P1Z2 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CALCOCO1Q9P1Z2 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CALCOCO1Q9P1Z2 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CALCOCO1Q9P1Z2 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.3 ms