Protein–RNA interactions for Protein: Q9P109

GCNT4, Beta-1,3-galactosyl-O-glycosyl-glycoprotein beta-1,6-N-acetylglucosaminyltransferase 4, humanhuman

Predictions only

Length 453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCNT4Q9P109 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GCNT4Q9P109 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GCNT4Q9P109 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GCNT4Q9P109 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
GCNT4Q9P109 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
GCNT4Q9P109 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GCNT4Q9P109 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
GCNT4Q9P109 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
GCNT4Q9P109 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
GCNT4Q9P109 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
GCNT4Q9P109 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
GCNT4Q9P109 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
GCNT4Q9P109 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
GCNT4Q9P109 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC24.48■■□□□ 1.51
GCNT4Q9P109 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
GCNT4Q9P109 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
GCNT4Q9P109 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
GCNT4Q9P109 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
GCNT4Q9P109 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
GCNT4Q9P109 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GCNT4Q9P109 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GCNT4Q9P109 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GCNT4Q9P109 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GCNT4Q9P109 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
GCNT4Q9P109 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
GCNT4Q9P109 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
GCNT4Q9P109 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
GCNT4Q9P109 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GCNT4Q9P109 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
GCNT4Q9P109 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GCNT4Q9P109 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
GCNT4Q9P109 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GCNT4Q9P109 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
GCNT4Q9P109 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
GCNT4Q9P109 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GCNT4Q9P109 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GCNT4Q9P109 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
GCNT4Q9P109 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
GCNT4Q9P109 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
GCNT4Q9P109 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
GCNT4Q9P109 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
GCNT4Q9P109 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
GCNT4Q9P109 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
GCNT4Q9P109 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
GCNT4Q9P109 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
GCNT4Q9P109 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
GCNT4Q9P109 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
GCNT4Q9P109 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
GCNT4Q9P109 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
GCNT4Q9P109 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
GCNT4Q9P109 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
GCNT4Q9P109 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
GCNT4Q9P109 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
GCNT4Q9P109 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
GCNT4Q9P109 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
GCNT4Q9P109 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
GCNT4Q9P109 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GCNT4Q9P109 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
GCNT4Q9P109 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
GCNT4Q9P109 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
GCNT4Q9P109 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
GCNT4Q9P109 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
GCNT4Q9P109 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GCNT4Q9P109 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GCNT4Q9P109 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
GCNT4Q9P109 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GCNT4Q9P109 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GCNT4Q9P109 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GCNT4Q9P109 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
GCNT4Q9P109 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GCNT4Q9P109 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
GCNT4Q9P109 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
GCNT4Q9P109 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GCNT4Q9P109 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GCNT4Q9P109 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
GCNT4Q9P109 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
GCNT4Q9P109 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GCNT4Q9P109 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
GCNT4Q9P109 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
GCNT4Q9P109 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
GCNT4Q9P109 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
GCNT4Q9P109 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
GCNT4Q9P109 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GCNT4Q9P109 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
GCNT4Q9P109 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GCNT4Q9P109 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GCNT4Q9P109 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GCNT4Q9P109 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
GCNT4Q9P109 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GCNT4Q9P109 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GCNT4Q9P109 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GCNT4Q9P109 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GCNT4Q9P109 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GCNT4Q9P109 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
GCNT4Q9P109 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
GCNT4Q9P109 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
GCNT4Q9P109 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GCNT4Q9P109 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GCNT4Q9P109 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
GCNT4Q9P109 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms