Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0U4

CXXC1, CXXC-type zinc finger protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 656 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXXC1Q9P0U4 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
CXXC1Q9P0U4 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CXXC1Q9P0U4 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CXXC1Q9P0U4 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CXXC1Q9P0U4 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CXXC1Q9P0U4 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CXXC1Q9P0U4 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CXXC1Q9P0U4 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CXXC1Q9P0U4 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
CXXC1Q9P0U4 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CXXC1Q9P0U4 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CXXC1Q9P0U4 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CXXC1Q9P0U4 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
CXXC1Q9P0U4 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CXXC1Q9P0U4 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CXXC1Q9P0U4 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CXXC1Q9P0U4 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CXXC1Q9P0U4 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CXXC1Q9P0U4 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CXXC1Q9P0U4 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CXXC1Q9P0U4 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CXXC1Q9P0U4 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CXXC1Q9P0U4 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CXXC1Q9P0U4 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
CXXC1Q9P0U4 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CXXC1Q9P0U4 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CXXC1Q9P0U4 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CXXC1Q9P0U4 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CXXC1Q9P0U4 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CXXC1Q9P0U4 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CXXC1Q9P0U4 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CXXC1Q9P0U4 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CXXC1Q9P0U4 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CXXC1Q9P0U4 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CXXC1Q9P0U4 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CXXC1Q9P0U4 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CXXC1Q9P0U4 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CXXC1Q9P0U4 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CXXC1Q9P0U4 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CXXC1Q9P0U4 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CXXC1Q9P0U4 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CXXC1Q9P0U4 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
CXXC1Q9P0U4 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CXXC1Q9P0U4 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
CXXC1Q9P0U4 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CXXC1Q9P0U4 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
CXXC1Q9P0U4 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
CXXC1Q9P0U4 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CXXC1Q9P0U4 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
CXXC1Q9P0U4 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CXXC1Q9P0U4 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CXXC1Q9P0U4 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CXXC1Q9P0U4 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CXXC1Q9P0U4 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CXXC1Q9P0U4 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CXXC1Q9P0U4 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CXXC1Q9P0U4 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CXXC1Q9P0U4 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CXXC1Q9P0U4 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CXXC1Q9P0U4 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CXXC1Q9P0U4 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CXXC1Q9P0U4 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CXXC1Q9P0U4 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CXXC1Q9P0U4 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CXXC1Q9P0U4 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CXXC1Q9P0U4 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CXXC1Q9P0U4 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CXXC1Q9P0U4 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CXXC1Q9P0U4 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CXXC1Q9P0U4 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CXXC1Q9P0U4 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
CXXC1Q9P0U4 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CXXC1Q9P0U4 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CXXC1Q9P0U4 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CXXC1Q9P0U4 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CXXC1Q9P0U4 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CXXC1Q9P0U4 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CXXC1Q9P0U4 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CXXC1Q9P0U4 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CXXC1Q9P0U4 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
CXXC1Q9P0U4 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CXXC1Q9P0U4 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CXXC1Q9P0U4 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CXXC1Q9P0U4 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CXXC1Q9P0U4 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CXXC1Q9P0U4 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CXXC1Q9P0U4 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CXXC1Q9P0U4 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CXXC1Q9P0U4 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CXXC1Q9P0U4 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CXXC1Q9P0U4 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CXXC1Q9P0U4 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
CXXC1Q9P0U4 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CXXC1Q9P0U4 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CXXC1Q9P0U4 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CXXC1Q9P0U4 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CXXC1Q9P0U4 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CXXC1Q9P0U4 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
CXXC1Q9P0U4 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CXXC1Q9P0U4 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms