Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZR1

TMOD2, Tropomodulin-2, humanhuman

Predictions only

Length 351 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD2Q9NZR1 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
TMOD2Q9NZR1 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
TMOD2Q9NZR1 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
TMOD2Q9NZR1 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TMOD2Q9NZR1 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TMOD2Q9NZR1 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TMOD2Q9NZR1 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
TMOD2Q9NZR1 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.85■■□□□ 1.89
TMOD2Q9NZR1 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
TMOD2Q9NZR1 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
TMOD2Q9NZR1 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
TMOD2Q9NZR1 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
TMOD2Q9NZR1 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
TMOD2Q9NZR1 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
TMOD2Q9NZR1 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
TMOD2Q9NZR1 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC26.83■■□□□ 1.89
TMOD2Q9NZR1 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
TMOD2Q9NZR1 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC26.83■■□□□ 1.89
TMOD2Q9NZR1 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
TMOD2Q9NZR1 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC26.83■■□□□ 1.89
TMOD2Q9NZR1 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
TMOD2Q9NZR1 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.88
TMOD2Q9NZR1 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
TMOD2Q9NZR1 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TMOD2Q9NZR1 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TMOD2Q9NZR1 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
TMOD2Q9NZR1 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
TMOD2Q9NZR1 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
TMOD2Q9NZR1 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
TMOD2Q9NZR1 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
TMOD2Q9NZR1 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TMOD2Q9NZR1 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TMOD2Q9NZR1 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TMOD2Q9NZR1 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
TMOD2Q9NZR1 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TMOD2Q9NZR1 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
TMOD2Q9NZR1 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TMOD2Q9NZR1 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TMOD2Q9NZR1 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TMOD2Q9NZR1 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC26.81■■□□□ 1.88
TMOD2Q9NZR1 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
TMOD2Q9NZR1 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
TMOD2Q9NZR1 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TMOD2Q9NZR1 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TMOD2Q9NZR1 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TMOD2Q9NZR1 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
TMOD2Q9NZR1 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TMOD2Q9NZR1 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
TMOD2Q9NZR1 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TMOD2Q9NZR1 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TMOD2Q9NZR1 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
TMOD2Q9NZR1 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
TMOD2Q9NZR1 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TMOD2Q9NZR1 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TMOD2Q9NZR1 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
TMOD2Q9NZR1 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
TMOD2Q9NZR1 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC26.8■■□□□ 1.88
TMOD2Q9NZR1 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TMOD2Q9NZR1 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
TMOD2Q9NZR1 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
TMOD2Q9NZR1 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
TMOD2Q9NZR1 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
TMOD2Q9NZR1 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
TMOD2Q9NZR1 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TMOD2Q9NZR1 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TMOD2Q9NZR1 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
TMOD2Q9NZR1 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
TMOD2Q9NZR1 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
TMOD2Q9NZR1 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
TMOD2Q9NZR1 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.78■■□□□ 1.88
TMOD2Q9NZR1 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TMOD2Q9NZR1 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TMOD2Q9NZR1 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TMOD2Q9NZR1 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TMOD2Q9NZR1 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
TMOD2Q9NZR1 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
TMOD2Q9NZR1 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
TMOD2Q9NZR1 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
TMOD2Q9NZR1 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
TMOD2Q9NZR1 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
TMOD2Q9NZR1 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
TMOD2Q9NZR1 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
TMOD2Q9NZR1 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
TMOD2Q9NZR1 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
TMOD2Q9NZR1 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
TMOD2Q9NZR1 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
TMOD2Q9NZR1 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
TMOD2Q9NZR1 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
TMOD2Q9NZR1 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
TMOD2Q9NZR1 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
TMOD2Q9NZR1 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
TMOD2Q9NZR1 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
TMOD2Q9NZR1 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
TMOD2Q9NZR1 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
TMOD2Q9NZR1 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
TMOD2Q9NZR1 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
TMOD2Q9NZR1 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
TMOD2Q9NZR1 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TMOD2Q9NZR1 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TMOD2Q9NZR1 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
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