Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZQ9

TMOD4, Tropomodulin-4, humanhuman

Predictions only

Length 345 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD4Q9NZQ9 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TMOD4Q9NZQ9 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TMOD4Q9NZQ9 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
TMOD4Q9NZQ9 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TMOD4Q9NZQ9 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
TMOD4Q9NZQ9 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TMOD4Q9NZQ9 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC26.22■■□□□ 1.79
TMOD4Q9NZQ9 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
TMOD4Q9NZQ9 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
TMOD4Q9NZQ9 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
TMOD4Q9NZQ9 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.21■■□□□ 1.79
TMOD4Q9NZQ9 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TMOD4Q9NZQ9 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
TMOD4Q9NZQ9 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TMOD4Q9NZQ9 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TMOD4Q9NZQ9 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
TMOD4Q9NZQ9 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
TMOD4Q9NZQ9 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
TMOD4Q9NZQ9 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
TMOD4Q9NZQ9 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC26.2■■□□□ 1.78
TMOD4Q9NZQ9 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
TMOD4Q9NZQ9 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
TMOD4Q9NZQ9 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
TMOD4Q9NZQ9 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
TMOD4Q9NZQ9 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
TMOD4Q9NZQ9 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TMOD4Q9NZQ9 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TMOD4Q9NZQ9 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
TMOD4Q9NZQ9 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
TMOD4Q9NZQ9 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC26.19■■□□□ 1.78
TMOD4Q9NZQ9 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TMOD4Q9NZQ9 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
TMOD4Q9NZQ9 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TMOD4Q9NZQ9 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
TMOD4Q9NZQ9 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TMOD4Q9NZQ9 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
TMOD4Q9NZQ9 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
TMOD4Q9NZQ9 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TMOD4Q9NZQ9 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
TMOD4Q9NZQ9 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TMOD4Q9NZQ9 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TMOD4Q9NZQ9 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TMOD4Q9NZQ9 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
TMOD4Q9NZQ9 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TMOD4Q9NZQ9 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
TMOD4Q9NZQ9 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TMOD4Q9NZQ9 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
TMOD4Q9NZQ9 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TMOD4Q9NZQ9 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC26.17■■□□□ 1.78
TMOD4Q9NZQ9 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
TMOD4Q9NZQ9 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
TMOD4Q9NZQ9 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TMOD4Q9NZQ9 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TMOD4Q9NZQ9 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.16■■□□□ 1.78
TMOD4Q9NZQ9 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
TMOD4Q9NZQ9 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
TMOD4Q9NZQ9 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
TMOD4Q9NZQ9 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TMOD4Q9NZQ9 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TMOD4Q9NZQ9 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
TMOD4Q9NZQ9 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
TMOD4Q9NZQ9 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TMOD4Q9NZQ9 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TMOD4Q9NZQ9 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
TMOD4Q9NZQ9 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
TMOD4Q9NZQ9 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
TMOD4Q9NZQ9 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
TMOD4Q9NZQ9 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.78
TMOD4Q9NZQ9 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
TMOD4Q9NZQ9 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
TMOD4Q9NZQ9 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
TMOD4Q9NZQ9 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
TMOD4Q9NZQ9 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
TMOD4Q9NZQ9 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
TMOD4Q9NZQ9 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
TMOD4Q9NZQ9 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
TMOD4Q9NZQ9 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
TMOD4Q9NZQ9 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
TMOD4Q9NZQ9 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
TMOD4Q9NZQ9 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
TMOD4Q9NZQ9 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
TMOD4Q9NZQ9 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TMOD4Q9NZQ9 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
TMOD4Q9NZQ9 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
TMOD4Q9NZQ9 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
TMOD4Q9NZQ9 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TMOD4Q9NZQ9 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TMOD4Q9NZQ9 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
TMOD4Q9NZQ9 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TMOD4Q9NZQ9 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
TMOD4Q9NZQ9 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
TMOD4Q9NZQ9 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
TMOD4Q9NZQ9 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
TMOD4Q9NZQ9 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
TMOD4Q9NZQ9 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TMOD4Q9NZQ9 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TMOD4Q9NZQ9 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TMOD4Q9NZQ9 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TMOD4Q9NZQ9 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TMOD4Q9NZQ9 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms