Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZM6

PKD2L2, Polycystic kidney disease 2-like 2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 624 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKD2L2Q9NZM6 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
PKD2L2Q9NZM6 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PKD2L2Q9NZM6 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PKD2L2Q9NZM6 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PKD2L2Q9NZM6 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PKD2L2Q9NZM6 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PKD2L2Q9NZM6 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PKD2L2Q9NZM6 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PKD2L2Q9NZM6 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PKD2L2Q9NZM6 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PKD2L2Q9NZM6 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PKD2L2Q9NZM6 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PKD2L2Q9NZM6 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PKD2L2Q9NZM6 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PKD2L2Q9NZM6 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
PKD2L2Q9NZM6 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PKD2L2Q9NZM6 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PKD2L2Q9NZM6 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PKD2L2Q9NZM6 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PKD2L2Q9NZM6 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PKD2L2Q9NZM6 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PKD2L2Q9NZM6 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PKD2L2Q9NZM6 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PKD2L2Q9NZM6 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PKD2L2Q9NZM6 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
PKD2L2Q9NZM6 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PKD2L2Q9NZM6 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PKD2L2Q9NZM6 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PKD2L2Q9NZM6 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PKD2L2Q9NZM6 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PKD2L2Q9NZM6 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
PKD2L2Q9NZM6 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PKD2L2Q9NZM6 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PKD2L2Q9NZM6 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PKD2L2Q9NZM6 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PKD2L2Q9NZM6 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PKD2L2Q9NZM6 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PKD2L2Q9NZM6 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PKD2L2Q9NZM6 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PKD2L2Q9NZM6 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PKD2L2Q9NZM6 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PKD2L2Q9NZM6 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PKD2L2Q9NZM6 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
PKD2L2Q9NZM6 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PKD2L2Q9NZM6 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PKD2L2Q9NZM6 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PKD2L2Q9NZM6 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PKD2L2Q9NZM6 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PKD2L2Q9NZM6 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PKD2L2Q9NZM6 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PKD2L2Q9NZM6 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PKD2L2Q9NZM6 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PKD2L2Q9NZM6 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PKD2L2Q9NZM6 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PKD2L2Q9NZM6 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PKD2L2Q9NZM6 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PKD2L2Q9NZM6 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PKD2L2Q9NZM6 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PKD2L2Q9NZM6 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PKD2L2Q9NZM6 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PKD2L2Q9NZM6 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PKD2L2Q9NZM6 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PKD2L2Q9NZM6 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PKD2L2Q9NZM6 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PKD2L2Q9NZM6 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PKD2L2Q9NZM6 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PKD2L2Q9NZM6 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PKD2L2Q9NZM6 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PKD2L2Q9NZM6 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PKD2L2Q9NZM6 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PKD2L2Q9NZM6 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
PKD2L2Q9NZM6 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PKD2L2Q9NZM6 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PKD2L2Q9NZM6 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PKD2L2Q9NZM6 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PKD2L2Q9NZM6 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
PKD2L2Q9NZM6 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PKD2L2Q9NZM6 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PKD2L2Q9NZM6 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PKD2L2Q9NZM6 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PKD2L2Q9NZM6 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PKD2L2Q9NZM6 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PKD2L2Q9NZM6 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PKD2L2Q9NZM6 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PKD2L2Q9NZM6 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PKD2L2Q9NZM6 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PKD2L2Q9NZM6 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PKD2L2Q9NZM6 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PKD2L2Q9NZM6 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PKD2L2Q9NZM6 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PKD2L2Q9NZM6 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PKD2L2Q9NZM6 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
PKD2L2Q9NZM6 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
PKD2L2Q9NZM6 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PKD2L2Q9NZM6 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PKD2L2Q9NZM6 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PKD2L2Q9NZM6 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PKD2L2Q9NZM6 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PKD2L2Q9NZM6 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PKD2L2Q9NZM6 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms