Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZ53

PODXL2, Podocalyxin-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 605 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PODXL2Q9NZ53 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
PODXL2Q9NZ53 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
PODXL2Q9NZ53 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
PODXL2Q9NZ53 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
PODXL2Q9NZ53 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
PODXL2Q9NZ53 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
PODXL2Q9NZ53 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
PODXL2Q9NZ53 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
PODXL2Q9NZ53 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PODXL2Q9NZ53 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
PODXL2Q9NZ53 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PODXL2Q9NZ53 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
PODXL2Q9NZ53 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PODXL2Q9NZ53 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
PODXL2Q9NZ53 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
PODXL2Q9NZ53 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
PODXL2Q9NZ53 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PODXL2Q9NZ53 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
PODXL2Q9NZ53 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PODXL2Q9NZ53 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PODXL2Q9NZ53 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PODXL2Q9NZ53 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PODXL2Q9NZ53 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PODXL2Q9NZ53 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
PODXL2Q9NZ53 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
PODXL2Q9NZ53 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PODXL2Q9NZ53 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PODXL2Q9NZ53 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
PODXL2Q9NZ53 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
PODXL2Q9NZ53 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PODXL2Q9NZ53 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
PODXL2Q9NZ53 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
PODXL2Q9NZ53 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PODXL2Q9NZ53 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC27.72■■■□□ 2.03
PODXL2Q9NZ53 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC27.72■■■□□ 2.03
PODXL2Q9NZ53 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
PODXL2Q9NZ53 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
PODXL2Q9NZ53 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PODXL2Q9NZ53 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PODXL2Q9NZ53 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC27.71■■■□□ 2.03
PODXL2Q9NZ53 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
PODXL2Q9NZ53 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PODXL2Q9NZ53 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PODXL2Q9NZ53 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PODXL2Q9NZ53 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
PODXL2Q9NZ53 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
PODXL2Q9NZ53 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
PODXL2Q9NZ53 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
PODXL2Q9NZ53 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
PODXL2Q9NZ53 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
PODXL2Q9NZ53 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
PODXL2Q9NZ53 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
PODXL2Q9NZ53 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
PODXL2Q9NZ53 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PODXL2Q9NZ53 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PODXL2Q9NZ53 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
PODXL2Q9NZ53 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
PODXL2Q9NZ53 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PODXL2Q9NZ53 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PODXL2Q9NZ53 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
PODXL2Q9NZ53 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PODXL2Q9NZ53 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PODXL2Q9NZ53 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
PODXL2Q9NZ53 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
PODXL2Q9NZ53 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PODXL2Q9NZ53 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PODXL2Q9NZ53 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC27.68■■■□□ 2.02
PODXL2Q9NZ53 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
PODXL2Q9NZ53 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
PODXL2Q9NZ53 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
PODXL2Q9NZ53 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.67■■■□□ 2.02
PODXL2Q9NZ53 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
PODXL2Q9NZ53 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
PODXL2Q9NZ53 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
PODXL2Q9NZ53 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
PODXL2Q9NZ53 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PODXL2Q9NZ53 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC27.66■■■□□ 2.02
PODXL2Q9NZ53 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
PODXL2Q9NZ53 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
PODXL2Q9NZ53 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
PODXL2Q9NZ53 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
PODXL2Q9NZ53 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
PODXL2Q9NZ53 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PODXL2Q9NZ53 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PODXL2Q9NZ53 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
PODXL2Q9NZ53 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PODXL2Q9NZ53 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
PODXL2Q9NZ53 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PODXL2Q9NZ53 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC27.65■■■□□ 2.02
PODXL2Q9NZ53 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PODXL2Q9NZ53 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
PODXL2Q9NZ53 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
PODXL2Q9NZ53 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
PODXL2Q9NZ53 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
PODXL2Q9NZ53 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
PODXL2Q9NZ53 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
PODXL2Q9NZ53 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.64■■■□□ 2.02
PODXL2Q9NZ53 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
PODXL2Q9NZ53 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
PODXL2Q9NZ53 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53 ms