Protein–RNA interactions for Protein: Q9NY99

SNTG2, Gamma-2-syntrophin, humanhuman

Predictions only

Length 539 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNTG2Q9NY99 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
SNTG2Q9NY99 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SNTG2Q9NY99 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SNTG2Q9NY99 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SNTG2Q9NY99 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SNTG2Q9NY99 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SNTG2Q9NY99 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SNTG2Q9NY99 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SNTG2Q9NY99 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SNTG2Q9NY99 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SNTG2Q9NY99 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SNTG2Q9NY99 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
SNTG2Q9NY99 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
SNTG2Q9NY99 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
SNTG2Q9NY99 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
SNTG2Q9NY99 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
SNTG2Q9NY99 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
SNTG2Q9NY99 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
SNTG2Q9NY99 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SNTG2Q9NY99 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SNTG2Q9NY99 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SNTG2Q9NY99 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SNTG2Q9NY99 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SNTG2Q9NY99 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
SNTG2Q9NY99 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SNTG2Q9NY99 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SNTG2Q9NY99 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SNTG2Q9NY99 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SNTG2Q9NY99 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SNTG2Q9NY99 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SNTG2Q9NY99 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
SNTG2Q9NY99 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
SNTG2Q9NY99 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.5
SNTG2Q9NY99 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SNTG2Q9NY99 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SNTG2Q9NY99 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SNTG2Q9NY99 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SNTG2Q9NY99 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
SNTG2Q9NY99 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SNTG2Q9NY99 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SNTG2Q9NY99 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SNTG2Q9NY99 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
SNTG2Q9NY99 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SNTG2Q9NY99 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SNTG2Q9NY99 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SNTG2Q9NY99 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SNTG2Q9NY99 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SNTG2Q9NY99 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
SNTG2Q9NY99 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SNTG2Q9NY99 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SNTG2Q9NY99 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SNTG2Q9NY99 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SNTG2Q9NY99 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SNTG2Q9NY99 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SNTG2Q9NY99 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SNTG2Q9NY99 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SNTG2Q9NY99 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SNTG2Q9NY99 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SNTG2Q9NY99 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SNTG2Q9NY99 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SNTG2Q9NY99 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SNTG2Q9NY99 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SNTG2Q9NY99 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SNTG2Q9NY99 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SNTG2Q9NY99 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SNTG2Q9NY99 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SNTG2Q9NY99 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SNTG2Q9NY99 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SNTG2Q9NY99 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SNTG2Q9NY99 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SNTG2Q9NY99 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SNTG2Q9NY99 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SNTG2Q9NY99 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SNTG2Q9NY99 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SNTG2Q9NY99 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SNTG2Q9NY99 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SNTG2Q9NY99 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SNTG2Q9NY99 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SNTG2Q9NY99 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SNTG2Q9NY99 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SNTG2Q9NY99 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SNTG2Q9NY99 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SNTG2Q9NY99 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SNTG2Q9NY99 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SNTG2Q9NY99 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SNTG2Q9NY99 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SNTG2Q9NY99 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SNTG2Q9NY99 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SNTG2Q9NY99 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SNTG2Q9NY99 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SNTG2Q9NY99 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SNTG2Q9NY99 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SNTG2Q9NY99 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SNTG2Q9NY99 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
SNTG2Q9NY99 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SNTG2Q9NY99 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SNTG2Q9NY99 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SNTG2Q9NY99 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SNTG2Q9NY99 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SNTG2Q9NY99 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms