Protein–RNA interactions for Protein: Q9NY84

VNN3, Vascular non-inflammatory molecule 3, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VNN3Q9NY84 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
VNN3Q9NY84 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
VNN3Q9NY84 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
VNN3Q9NY84 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
VNN3Q9NY84 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
VNN3Q9NY84 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
VNN3Q9NY84 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
VNN3Q9NY84 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
VNN3Q9NY84 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
VNN3Q9NY84 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
VNN3Q9NY84 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
VNN3Q9NY84 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
VNN3Q9NY84 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
VNN3Q9NY84 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
VNN3Q9NY84 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
VNN3Q9NY84 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
VNN3Q9NY84 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
VNN3Q9NY84 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
VNN3Q9NY84 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
VNN3Q9NY84 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
VNN3Q9NY84 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
VNN3Q9NY84 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
VNN3Q9NY84 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
VNN3Q9NY84 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
VNN3Q9NY84 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
VNN3Q9NY84 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
VNN3Q9NY84 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
VNN3Q9NY84 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
VNN3Q9NY84 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
VNN3Q9NY84 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
VNN3Q9NY84 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
VNN3Q9NY84 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
VNN3Q9NY84 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
VNN3Q9NY84 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
VNN3Q9NY84 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
VNN3Q9NY84 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
VNN3Q9NY84 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
VNN3Q9NY84 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
VNN3Q9NY84 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
VNN3Q9NY84 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
VNN3Q9NY84 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
VNN3Q9NY84 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
VNN3Q9NY84 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
VNN3Q9NY84 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
VNN3Q9NY84 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
VNN3Q9NY84 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
VNN3Q9NY84 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
VNN3Q9NY84 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
VNN3Q9NY84 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
VNN3Q9NY84 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
VNN3Q9NY84 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
VNN3Q9NY84 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
VNN3Q9NY84 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
VNN3Q9NY84 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
VNN3Q9NY84 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
VNN3Q9NY84 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
VNN3Q9NY84 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
VNN3Q9NY84 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
VNN3Q9NY84 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
VNN3Q9NY84 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
VNN3Q9NY84 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
VNN3Q9NY84 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
VNN3Q9NY84 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
VNN3Q9NY84 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
VNN3Q9NY84 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
VNN3Q9NY84 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC20.79■□□□□ 0.92
VNN3Q9NY84 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
VNN3Q9NY84 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
VNN3Q9NY84 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
VNN3Q9NY84 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
VNN3Q9NY84 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
VNN3Q9NY84 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
VNN3Q9NY84 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
VNN3Q9NY84 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
VNN3Q9NY84 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
VNN3Q9NY84 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
VNN3Q9NY84 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
VNN3Q9NY84 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
VNN3Q9NY84 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
VNN3Q9NY84 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
VNN3Q9NY84 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
VNN3Q9NY84 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
VNN3Q9NY84 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
VNN3Q9NY84 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.92
VNN3Q9NY84 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
VNN3Q9NY84 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
VNN3Q9NY84 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
VNN3Q9NY84 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
VNN3Q9NY84 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
VNN3Q9NY84 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
VNN3Q9NY84 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
VNN3Q9NY84 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
VNN3Q9NY84 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
VNN3Q9NY84 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
VNN3Q9NY84 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
VNN3Q9NY84 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
VNN3Q9NY84 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
VNN3Q9NY84 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
VNN3Q9NY84 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
VNN3Q9NY84 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms