Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXL9

MCM9, DNA helicase MCM9, humanhuman

Predictions only

Length 1,143 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCM9Q9NXL9 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
MCM9Q9NXL9 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
MCM9Q9NXL9 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
MCM9Q9NXL9 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
MCM9Q9NXL9 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC26.77■■□□□ 1.88
MCM9Q9NXL9 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
MCM9Q9NXL9 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
MCM9Q9NXL9 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
MCM9Q9NXL9 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
MCM9Q9NXL9 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
MCM9Q9NXL9 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
MCM9Q9NXL9 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
MCM9Q9NXL9 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
MCM9Q9NXL9 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
MCM9Q9NXL9 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
MCM9Q9NXL9 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.88
MCM9Q9NXL9 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
MCM9Q9NXL9 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
MCM9Q9NXL9 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
MCM9Q9NXL9 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
MCM9Q9NXL9 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
MCM9Q9NXL9 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
MCM9Q9NXL9 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
MCM9Q9NXL9 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
MCM9Q9NXL9 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
MCM9Q9NXL9 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
MCM9Q9NXL9 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
MCM9Q9NXL9 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
MCM9Q9NXL9 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
MCM9Q9NXL9 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
MCM9Q9NXL9 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
MCM9Q9NXL9 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
MCM9Q9NXL9 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
MCM9Q9NXL9 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
MCM9Q9NXL9 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
MCM9Q9NXL9 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
MCM9Q9NXL9 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
MCM9Q9NXL9 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
MCM9Q9NXL9 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
MCM9Q9NXL9 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
MCM9Q9NXL9 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
MCM9Q9NXL9 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
MCM9Q9NXL9 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
MCM9Q9NXL9 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
MCM9Q9NXL9 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
MCM9Q9NXL9 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC26.73■■□□□ 1.87
MCM9Q9NXL9 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
MCM9Q9NXL9 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
MCM9Q9NXL9 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
MCM9Q9NXL9 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
MCM9Q9NXL9 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
MCM9Q9NXL9 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
MCM9Q9NXL9 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
MCM9Q9NXL9 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
MCM9Q9NXL9 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
MCM9Q9NXL9 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
MCM9Q9NXL9 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
MCM9Q9NXL9 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
MCM9Q9NXL9 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC26.72■■□□□ 1.87
MCM9Q9NXL9 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
MCM9Q9NXL9 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
MCM9Q9NXL9 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
MCM9Q9NXL9 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
MCM9Q9NXL9 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
MCM9Q9NXL9 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
MCM9Q9NXL9 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
MCM9Q9NXL9 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
MCM9Q9NXL9 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
MCM9Q9NXL9 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
MCM9Q9NXL9 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
MCM9Q9NXL9 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
MCM9Q9NXL9 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
MCM9Q9NXL9 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
MCM9Q9NXL9 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
MCM9Q9NXL9 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
MCM9Q9NXL9 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
MCM9Q9NXL9 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
MCM9Q9NXL9 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
MCM9Q9NXL9 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
MCM9Q9NXL9 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
MCM9Q9NXL9 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
MCM9Q9NXL9 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
MCM9Q9NXL9 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
MCM9Q9NXL9 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
MCM9Q9NXL9 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
MCM9Q9NXL9 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
MCM9Q9NXL9 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
MCM9Q9NXL9 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
MCM9Q9NXL9 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
MCM9Q9NXL9 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
MCM9Q9NXL9 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
MCM9Q9NXL9 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
MCM9Q9NXL9 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
MCM9Q9NXL9 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
MCM9Q9NXL9 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
MCM9Q9NXL9 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
MCM9Q9NXL9 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
MCM9Q9NXL9 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
MCM9Q9NXL9 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
MCM9Q9NXL9 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms