Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX77

ERVK13-1, Endogenous retrovirus group K member 13-1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK13-1Q9NX77 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ERVK13-1Q9NX77 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ERVK13-1Q9NX77 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ERVK13-1Q9NX77 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ERVK13-1Q9NX77 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ERVK13-1Q9NX77 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ERVK13-1Q9NX77 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ERVK13-1Q9NX77 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ERVK13-1Q9NX77 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ERVK13-1Q9NX77 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ERVK13-1Q9NX77 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ERVK13-1Q9NX77 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ERVK13-1Q9NX77 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ERVK13-1Q9NX77 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ERVK13-1Q9NX77 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
ERVK13-1Q9NX77 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ERVK13-1Q9NX77 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ERVK13-1Q9NX77 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ERVK13-1Q9NX77 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ERVK13-1Q9NX77 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ERVK13-1Q9NX77 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ERVK13-1Q9NX77 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ERVK13-1Q9NX77 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
ERVK13-1Q9NX77 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ERVK13-1Q9NX77 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ERVK13-1Q9NX77 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
ERVK13-1Q9NX77 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ERVK13-1Q9NX77 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ERVK13-1Q9NX77 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ERVK13-1Q9NX77 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ERVK13-1Q9NX77 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ERVK13-1Q9NX77 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ERVK13-1Q9NX77 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ERVK13-1Q9NX77 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ERVK13-1Q9NX77 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ERVK13-1Q9NX77 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ERVK13-1Q9NX77 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ERVK13-1Q9NX77 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ERVK13-1Q9NX77 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
ERVK13-1Q9NX77 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ERVK13-1Q9NX77 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ERVK13-1Q9NX77 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ERVK13-1Q9NX77 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ERVK13-1Q9NX77 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ERVK13-1Q9NX77 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ERVK13-1Q9NX77 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ERVK13-1Q9NX77 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ERVK13-1Q9NX77 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ERVK13-1Q9NX77 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ERVK13-1Q9NX77 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ERVK13-1Q9NX77 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ERVK13-1Q9NX77 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ERVK13-1Q9NX77 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ERVK13-1Q9NX77 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ERVK13-1Q9NX77 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ERVK13-1Q9NX77 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ERVK13-1Q9NX77 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ERVK13-1Q9NX77 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ERVK13-1Q9NX77 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ERVK13-1Q9NX77 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ERVK13-1Q9NX77 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ERVK13-1Q9NX77 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ERVK13-1Q9NX77 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ERVK13-1Q9NX77 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ERVK13-1Q9NX77 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ERVK13-1Q9NX77 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ERVK13-1Q9NX77 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ERVK13-1Q9NX77 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ERVK13-1Q9NX77 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ERVK13-1Q9NX77 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ERVK13-1Q9NX77 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ERVK13-1Q9NX77 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ERVK13-1Q9NX77 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ERVK13-1Q9NX77 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ERVK13-1Q9NX77 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ERVK13-1Q9NX77 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ERVK13-1Q9NX77 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ERVK13-1Q9NX77 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ERVK13-1Q9NX77 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ERVK13-1Q9NX77 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ERVK13-1Q9NX77 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ERVK13-1Q9NX77 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
ERVK13-1Q9NX77 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
ERVK13-1Q9NX77 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ERVK13-1Q9NX77 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ERVK13-1Q9NX77 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ERVK13-1Q9NX77 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ERVK13-1Q9NX77 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
ERVK13-1Q9NX77 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ERVK13-1Q9NX77 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ERVK13-1Q9NX77 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ERVK13-1Q9NX77 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ERVK13-1Q9NX77 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ERVK13-1Q9NX77 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ERVK13-1Q9NX77 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ERVK13-1Q9NX77 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ERVK13-1Q9NX77 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ERVK13-1Q9NX77 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ERVK13-1Q9NX77 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ERVK13-1Q9NX77 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70 ms