Protein–RNA interactions for Protein: Q9NW08

POLR3B, DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR3BQ9NW08 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
POLR3BQ9NW08 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
POLR3BQ9NW08 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
POLR3BQ9NW08 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
POLR3BQ9NW08 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
POLR3BQ9NW08 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
POLR3BQ9NW08 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
POLR3BQ9NW08 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
POLR3BQ9NW08 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
POLR3BQ9NW08 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
POLR3BQ9NW08 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
POLR3BQ9NW08 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
POLR3BQ9NW08 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
POLR3BQ9NW08 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
POLR3BQ9NW08 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
POLR3BQ9NW08 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
POLR3BQ9NW08 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
POLR3BQ9NW08 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
POLR3BQ9NW08 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
POLR3BQ9NW08 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
POLR3BQ9NW08 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
POLR3BQ9NW08 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
POLR3BQ9NW08 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
POLR3BQ9NW08 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
POLR3BQ9NW08 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
POLR3BQ9NW08 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
POLR3BQ9NW08 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
POLR3BQ9NW08 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
POLR3BQ9NW08 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
POLR3BQ9NW08 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
POLR3BQ9NW08 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
POLR3BQ9NW08 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
POLR3BQ9NW08 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
POLR3BQ9NW08 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
POLR3BQ9NW08 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
POLR3BQ9NW08 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
POLR3BQ9NW08 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
POLR3BQ9NW08 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
POLR3BQ9NW08 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
POLR3BQ9NW08 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
POLR3BQ9NW08 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
POLR3BQ9NW08 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
POLR3BQ9NW08 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
POLR3BQ9NW08 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
POLR3BQ9NW08 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
POLR3BQ9NW08 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
POLR3BQ9NW08 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
POLR3BQ9NW08 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
POLR3BQ9NW08 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
POLR3BQ9NW08 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
POLR3BQ9NW08 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
POLR3BQ9NW08 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
POLR3BQ9NW08 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
POLR3BQ9NW08 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
POLR3BQ9NW08 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
POLR3BQ9NW08 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
POLR3BQ9NW08 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
POLR3BQ9NW08 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
POLR3BQ9NW08 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
POLR3BQ9NW08 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
POLR3BQ9NW08 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
POLR3BQ9NW08 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
POLR3BQ9NW08 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
POLR3BQ9NW08 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
POLR3BQ9NW08 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
POLR3BQ9NW08 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
POLR3BQ9NW08 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
POLR3BQ9NW08 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
POLR3BQ9NW08 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
POLR3BQ9NW08 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
POLR3BQ9NW08 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
POLR3BQ9NW08 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
POLR3BQ9NW08 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
POLR3BQ9NW08 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
POLR3BQ9NW08 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
POLR3BQ9NW08 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
POLR3BQ9NW08 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
POLR3BQ9NW08 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
POLR3BQ9NW08 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
POLR3BQ9NW08 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
POLR3BQ9NW08 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
POLR3BQ9NW08 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
POLR3BQ9NW08 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
POLR3BQ9NW08 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
POLR3BQ9NW08 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
POLR3BQ9NW08 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
POLR3BQ9NW08 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
POLR3BQ9NW08 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
POLR3BQ9NW08 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
POLR3BQ9NW08 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.28
POLR3BQ9NW08 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
POLR3BQ9NW08 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
POLR3BQ9NW08 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
POLR3BQ9NW08 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
POLR3BQ9NW08 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
POLR3BQ9NW08 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
POLR3BQ9NW08 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
POLR3BQ9NW08 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
POLR3BQ9NW08 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
POLR3BQ9NW08 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms