Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVP1

DDX18, ATP-dependent RNA helicase DDX18, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 670 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX18Q9NVP1 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
DDX18Q9NVP1 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
DDX18Q9NVP1 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
DDX18Q9NVP1 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
DDX18Q9NVP1 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
DDX18Q9NVP1 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
DDX18Q9NVP1 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
DDX18Q9NVP1 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
DDX18Q9NVP1 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
DDX18Q9NVP1 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
DDX18Q9NVP1 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
DDX18Q9NVP1 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
DDX18Q9NVP1 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
DDX18Q9NVP1 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
DDX18Q9NVP1 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
DDX18Q9NVP1 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
DDX18Q9NVP1 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
DDX18Q9NVP1 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
DDX18Q9NVP1 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
DDX18Q9NVP1 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
DDX18Q9NVP1 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
DDX18Q9NVP1 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
DDX18Q9NVP1 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
DDX18Q9NVP1 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
DDX18Q9NVP1 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
DDX18Q9NVP1 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
DDX18Q9NVP1 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
DDX18Q9NVP1 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
DDX18Q9NVP1 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
DDX18Q9NVP1 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
DDX18Q9NVP1 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
DDX18Q9NVP1 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
DDX18Q9NVP1 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
DDX18Q9NVP1 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
DDX18Q9NVP1 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
DDX18Q9NVP1 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
DDX18Q9NVP1 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
DDX18Q9NVP1 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
DDX18Q9NVP1 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
DDX18Q9NVP1 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
DDX18Q9NVP1 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
DDX18Q9NVP1 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
DDX18Q9NVP1 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
DDX18Q9NVP1 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
DDX18Q9NVP1 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
DDX18Q9NVP1 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
DDX18Q9NVP1 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
DDX18Q9NVP1 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
DDX18Q9NVP1 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
DDX18Q9NVP1 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
DDX18Q9NVP1 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
DDX18Q9NVP1 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
DDX18Q9NVP1 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
DDX18Q9NVP1 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
DDX18Q9NVP1 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
DDX18Q9NVP1 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
DDX18Q9NVP1 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
DDX18Q9NVP1 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
DDX18Q9NVP1 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
DDX18Q9NVP1 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
DDX18Q9NVP1 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
DDX18Q9NVP1 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
DDX18Q9NVP1 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
DDX18Q9NVP1 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
DDX18Q9NVP1 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
DDX18Q9NVP1 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
DDX18Q9NVP1 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
DDX18Q9NVP1 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
DDX18Q9NVP1 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
DDX18Q9NVP1 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
DDX18Q9NVP1 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
DDX18Q9NVP1 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
DDX18Q9NVP1 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
DDX18Q9NVP1 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
DDX18Q9NVP1 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
DDX18Q9NVP1 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
DDX18Q9NVP1 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
DDX18Q9NVP1 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
DDX18Q9NVP1 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
DDX18Q9NVP1 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
DDX18Q9NVP1 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
DDX18Q9NVP1 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
DDX18Q9NVP1 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
DDX18Q9NVP1 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
DDX18Q9NVP1 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
DDX18Q9NVP1 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
DDX18Q9NVP1 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
DDX18Q9NVP1 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
DDX18Q9NVP1 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
DDX18Q9NVP1 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
DDX18Q9NVP1 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
DDX18Q9NVP1 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
DDX18Q9NVP1 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
DDX18Q9NVP1 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
DDX18Q9NVP1 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
DDX18Q9NVP1 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
DDX18Q9NVP1 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
DDX18Q9NVP1 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
DDX18Q9NVP1 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
DDX18Q9NVP1 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
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