Protein–RNA interactions for Protein: Q9NV06

DCAF13, DDB1- and CUL4-associated factor 13, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 445 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCAF13Q9NV06 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
DCAF13Q9NV06 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
DCAF13Q9NV06 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
DCAF13Q9NV06 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
DCAF13Q9NV06 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
DCAF13Q9NV06 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
DCAF13Q9NV06 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
DCAF13Q9NV06 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
DCAF13Q9NV06 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
DCAF13Q9NV06 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
DCAF13Q9NV06 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
DCAF13Q9NV06 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
DCAF13Q9NV06 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
DCAF13Q9NV06 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
DCAF13Q9NV06 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
DCAF13Q9NV06 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
DCAF13Q9NV06 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
DCAF13Q9NV06 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
DCAF13Q9NV06 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
DCAF13Q9NV06 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
DCAF13Q9NV06 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
DCAF13Q9NV06 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
DCAF13Q9NV06 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
DCAF13Q9NV06 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
DCAF13Q9NV06 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
DCAF13Q9NV06 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
DCAF13Q9NV06 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
DCAF13Q9NV06 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
DCAF13Q9NV06 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
DCAF13Q9NV06 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
DCAF13Q9NV06 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
DCAF13Q9NV06 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
DCAF13Q9NV06 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
DCAF13Q9NV06 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
DCAF13Q9NV06 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
DCAF13Q9NV06 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
DCAF13Q9NV06 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
DCAF13Q9NV06 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
DCAF13Q9NV06 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
DCAF13Q9NV06 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
DCAF13Q9NV06 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
DCAF13Q9NV06 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
DCAF13Q9NV06 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
DCAF13Q9NV06 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
DCAF13Q9NV06 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
DCAF13Q9NV06 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
DCAF13Q9NV06 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
DCAF13Q9NV06 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
DCAF13Q9NV06 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
DCAF13Q9NV06 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
DCAF13Q9NV06 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
DCAF13Q9NV06 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
DCAF13Q9NV06 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
DCAF13Q9NV06 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
DCAF13Q9NV06 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
DCAF13Q9NV06 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
DCAF13Q9NV06 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
DCAF13Q9NV06 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
DCAF13Q9NV06 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
DCAF13Q9NV06 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
DCAF13Q9NV06 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
DCAF13Q9NV06 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
DCAF13Q9NV06 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
DCAF13Q9NV06 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
DCAF13Q9NV06 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
DCAF13Q9NV06 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
DCAF13Q9NV06 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
DCAF13Q9NV06 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
DCAF13Q9NV06 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
DCAF13Q9NV06 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
DCAF13Q9NV06 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
DCAF13Q9NV06 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
DCAF13Q9NV06 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
DCAF13Q9NV06 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
DCAF13Q9NV06 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
DCAF13Q9NV06 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
DCAF13Q9NV06 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
DCAF13Q9NV06 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
DCAF13Q9NV06 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
DCAF13Q9NV06 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
DCAF13Q9NV06 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
DCAF13Q9NV06 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
DCAF13Q9NV06 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
DCAF13Q9NV06 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
DCAF13Q9NV06 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
DCAF13Q9NV06 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
DCAF13Q9NV06 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
DCAF13Q9NV06 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
DCAF13Q9NV06 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
DCAF13Q9NV06 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
DCAF13Q9NV06 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
DCAF13Q9NV06 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
DCAF13Q9NV06 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
DCAF13Q9NV06 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
DCAF13Q9NV06 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
DCAF13Q9NV06 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
DCAF13Q9NV06 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
DCAF13Q9NV06 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
DCAF13Q9NV06 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
DCAF13Q9NV06 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms