Protein–RNA interactions for Protein: Q9NU23

LYRM2, LYR motif-containing protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 88 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LYRM2Q9NU23 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
LYRM2Q9NU23 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LYRM2Q9NU23 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LYRM2Q9NU23 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
LYRM2Q9NU23 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
LYRM2Q9NU23 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
LYRM2Q9NU23 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LYRM2Q9NU23 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LYRM2Q9NU23 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LYRM2Q9NU23 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LYRM2Q9NU23 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LYRM2Q9NU23 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LYRM2Q9NU23 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LYRM2Q9NU23 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LYRM2Q9NU23 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LYRM2Q9NU23 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LYRM2Q9NU23 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LYRM2Q9NU23 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
LYRM2Q9NU23 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LYRM2Q9NU23 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
LYRM2Q9NU23 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
LYRM2Q9NU23 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
LYRM2Q9NU23 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
LYRM2Q9NU23 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LYRM2Q9NU23 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
LYRM2Q9NU23 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
LYRM2Q9NU23 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LYRM2Q9NU23 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
LYRM2Q9NU23 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
LYRM2Q9NU23 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
LYRM2Q9NU23 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
LYRM2Q9NU23 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
LYRM2Q9NU23 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
LYRM2Q9NU23 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
LYRM2Q9NU23 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
LYRM2Q9NU23 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
LYRM2Q9NU23 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
LYRM2Q9NU23 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
LYRM2Q9NU23 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
LYRM2Q9NU23 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
LYRM2Q9NU23 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
LYRM2Q9NU23 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
LYRM2Q9NU23 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
LYRM2Q9NU23 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
LYRM2Q9NU23 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
LYRM2Q9NU23 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
LYRM2Q9NU23 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
LYRM2Q9NU23 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
LYRM2Q9NU23 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
LYRM2Q9NU23 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
LYRM2Q9NU23 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
LYRM2Q9NU23 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
LYRM2Q9NU23 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
LYRM2Q9NU23 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
LYRM2Q9NU23 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
LYRM2Q9NU23 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
LYRM2Q9NU23 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
LYRM2Q9NU23 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
LYRM2Q9NU23 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
LYRM2Q9NU23 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
LYRM2Q9NU23 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
LYRM2Q9NU23 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
LYRM2Q9NU23 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
LYRM2Q9NU23 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
LYRM2Q9NU23 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
LYRM2Q9NU23 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
LYRM2Q9NU23 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
LYRM2Q9NU23 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
LYRM2Q9NU23 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
LYRM2Q9NU23 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
LYRM2Q9NU23 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
LYRM2Q9NU23 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
LYRM2Q9NU23 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
LYRM2Q9NU23 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
LYRM2Q9NU23 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LYRM2Q9NU23 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
LYRM2Q9NU23 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LYRM2Q9NU23 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LYRM2Q9NU23 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LYRM2Q9NU23 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LYRM2Q9NU23 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LYRM2Q9NU23 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LYRM2Q9NU23 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LYRM2Q9NU23 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
LYRM2Q9NU23 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
LYRM2Q9NU23 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LYRM2Q9NU23 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
LYRM2Q9NU23 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
LYRM2Q9NU23 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
LYRM2Q9NU23 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
LYRM2Q9NU23 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
LYRM2Q9NU23 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
LYRM2Q9NU23 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
LYRM2Q9NU23 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LYRM2Q9NU23 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
LYRM2Q9NU23 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LYRM2Q9NU23 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LYRM2Q9NU23 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
LYRM2Q9NU23 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LYRM2Q9NU23 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms