Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSC5

HOMER3, Homer protein homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOMER3Q9NSC5 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
HOMER3Q9NSC5 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
HOMER3Q9NSC5 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
HOMER3Q9NSC5 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
HOMER3Q9NSC5 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
HOMER3Q9NSC5 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
HOMER3Q9NSC5 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
HOMER3Q9NSC5 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
HOMER3Q9NSC5 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
HOMER3Q9NSC5 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HOMER3Q9NSC5 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HOMER3Q9NSC5 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
HOMER3Q9NSC5 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
HOMER3Q9NSC5 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
HOMER3Q9NSC5 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
HOMER3Q9NSC5 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HOMER3Q9NSC5 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HOMER3Q9NSC5 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
HOMER3Q9NSC5 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HOMER3Q9NSC5 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HOMER3Q9NSC5 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HOMER3Q9NSC5 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
HOMER3Q9NSC5 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HOMER3Q9NSC5 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HOMER3Q9NSC5 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
HOMER3Q9NSC5 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
HOMER3Q9NSC5 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
HOMER3Q9NSC5 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
HOMER3Q9NSC5 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
HOMER3Q9NSC5 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
HOMER3Q9NSC5 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
HOMER3Q9NSC5 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
HOMER3Q9NSC5 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
HOMER3Q9NSC5 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.32
HOMER3Q9NSC5 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
HOMER3Q9NSC5 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
HOMER3Q9NSC5 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
HOMER3Q9NSC5 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HOMER3Q9NSC5 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HOMER3Q9NSC5 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
HOMER3Q9NSC5 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
HOMER3Q9NSC5 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
HOMER3Q9NSC5 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
HOMER3Q9NSC5 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HOMER3Q9NSC5 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HOMER3Q9NSC5 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HOMER3Q9NSC5 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HOMER3Q9NSC5 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HOMER3Q9NSC5 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HOMER3Q9NSC5 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HOMER3Q9NSC5 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HOMER3Q9NSC5 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
HOMER3Q9NSC5 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
HOMER3Q9NSC5 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HOMER3Q9NSC5 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
HOMER3Q9NSC5 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
HOMER3Q9NSC5 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HOMER3Q9NSC5 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
HOMER3Q9NSC5 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
HOMER3Q9NSC5 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HOMER3Q9NSC5 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HOMER3Q9NSC5 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HOMER3Q9NSC5 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
HOMER3Q9NSC5 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HOMER3Q9NSC5 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HOMER3Q9NSC5 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HOMER3Q9NSC5 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
HOMER3Q9NSC5 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HOMER3Q9NSC5 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HOMER3Q9NSC5 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HOMER3Q9NSC5 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
HOMER3Q9NSC5 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
HOMER3Q9NSC5 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
HOMER3Q9NSC5 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HOMER3Q9NSC5 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HOMER3Q9NSC5 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
HOMER3Q9NSC5 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
HOMER3Q9NSC5 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HOMER3Q9NSC5 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
HOMER3Q9NSC5 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
HOMER3Q9NSC5 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
HOMER3Q9NSC5 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
HOMER3Q9NSC5 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
HOMER3Q9NSC5 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
HOMER3Q9NSC5 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
HOMER3Q9NSC5 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HOMER3Q9NSC5 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
HOMER3Q9NSC5 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HOMER3Q9NSC5 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HOMER3Q9NSC5 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HOMER3Q9NSC5 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
HOMER3Q9NSC5 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HOMER3Q9NSC5 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HOMER3Q9NSC5 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
HOMER3Q9NSC5 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HOMER3Q9NSC5 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
HOMER3Q9NSC5 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
HOMER3Q9NSC5 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HOMER3Q9NSC5 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
HOMER3Q9NSC5 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.6 ms