Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRX4

PHPT1, 14 kDa phosphohistidine phosphatase, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHPT1Q9NRX4 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PHPT1Q9NRX4 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PHPT1Q9NRX4 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PHPT1Q9NRX4 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PHPT1Q9NRX4 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
PHPT1Q9NRX4 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
PHPT1Q9NRX4 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PHPT1Q9NRX4 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PHPT1Q9NRX4 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PHPT1Q9NRX4 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PHPT1Q9NRX4 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PHPT1Q9NRX4 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PHPT1Q9NRX4 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PHPT1Q9NRX4 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PHPT1Q9NRX4 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
PHPT1Q9NRX4 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PHPT1Q9NRX4 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PHPT1Q9NRX4 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PHPT1Q9NRX4 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PHPT1Q9NRX4 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PHPT1Q9NRX4 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PHPT1Q9NRX4 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PHPT1Q9NRX4 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PHPT1Q9NRX4 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
PHPT1Q9NRX4 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
PHPT1Q9NRX4 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PHPT1Q9NRX4 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PHPT1Q9NRX4 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PHPT1Q9NRX4 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
PHPT1Q9NRX4 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PHPT1Q9NRX4 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PHPT1Q9NRX4 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PHPT1Q9NRX4 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PHPT1Q9NRX4 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
PHPT1Q9NRX4 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
PHPT1Q9NRX4 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PHPT1Q9NRX4 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
PHPT1Q9NRX4 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
PHPT1Q9NRX4 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PHPT1Q9NRX4 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PHPT1Q9NRX4 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PHPT1Q9NRX4 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PHPT1Q9NRX4 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PHPT1Q9NRX4 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PHPT1Q9NRX4 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PHPT1Q9NRX4 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PHPT1Q9NRX4 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PHPT1Q9NRX4 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PHPT1Q9NRX4 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PHPT1Q9NRX4 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PHPT1Q9NRX4 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
PHPT1Q9NRX4 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
PHPT1Q9NRX4 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PHPT1Q9NRX4 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PHPT1Q9NRX4 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PHPT1Q9NRX4 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PHPT1Q9NRX4 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PHPT1Q9NRX4 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PHPT1Q9NRX4 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PHPT1Q9NRX4 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PHPT1Q9NRX4 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PHPT1Q9NRX4 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PHPT1Q9NRX4 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
PHPT1Q9NRX4 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PHPT1Q9NRX4 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PHPT1Q9NRX4 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PHPT1Q9NRX4 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PHPT1Q9NRX4 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PHPT1Q9NRX4 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
PHPT1Q9NRX4 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PHPT1Q9NRX4 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
PHPT1Q9NRX4 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PHPT1Q9NRX4 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PHPT1Q9NRX4 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PHPT1Q9NRX4 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PHPT1Q9NRX4 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PHPT1Q9NRX4 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PHPT1Q9NRX4 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PHPT1Q9NRX4 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PHPT1Q9NRX4 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PHPT1Q9NRX4 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PHPT1Q9NRX4 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PHPT1Q9NRX4 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
PHPT1Q9NRX4 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PHPT1Q9NRX4 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PHPT1Q9NRX4 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PHPT1Q9NRX4 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PHPT1Q9NRX4 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PHPT1Q9NRX4 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PHPT1Q9NRX4 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
PHPT1Q9NRX4 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PHPT1Q9NRX4 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PHPT1Q9NRX4 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PHPT1Q9NRX4 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PHPT1Q9NRX4 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PHPT1Q9NRX4 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PHPT1Q9NRX4 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PHPT1Q9NRX4 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PHPT1Q9NRX4 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PHPT1Q9NRX4 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms