Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRS6

SNX15, Sorting nexin-15, humanhuman

Predictions only

Length 342 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX15Q9NRS6 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SNX15Q9NRS6 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SNX15Q9NRS6 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SNX15Q9NRS6 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SNX15Q9NRS6 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SNX15Q9NRS6 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SNX15Q9NRS6 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SNX15Q9NRS6 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SNX15Q9NRS6 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SNX15Q9NRS6 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SNX15Q9NRS6 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SNX15Q9NRS6 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SNX15Q9NRS6 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SNX15Q9NRS6 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SNX15Q9NRS6 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SNX15Q9NRS6 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SNX15Q9NRS6 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SNX15Q9NRS6 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SNX15Q9NRS6 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SNX15Q9NRS6 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SNX15Q9NRS6 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SNX15Q9NRS6 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SNX15Q9NRS6 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SNX15Q9NRS6 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SNX15Q9NRS6 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SNX15Q9NRS6 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SNX15Q9NRS6 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SNX15Q9NRS6 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
SNX15Q9NRS6 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SNX15Q9NRS6 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SNX15Q9NRS6 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SNX15Q9NRS6 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SNX15Q9NRS6 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SNX15Q9NRS6 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SNX15Q9NRS6 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SNX15Q9NRS6 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SNX15Q9NRS6 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SNX15Q9NRS6 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SNX15Q9NRS6 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SNX15Q9NRS6 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SNX15Q9NRS6 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SNX15Q9NRS6 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
SNX15Q9NRS6 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SNX15Q9NRS6 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SNX15Q9NRS6 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SNX15Q9NRS6 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SNX15Q9NRS6 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SNX15Q9NRS6 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SNX15Q9NRS6 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SNX15Q9NRS6 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SNX15Q9NRS6 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SNX15Q9NRS6 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SNX15Q9NRS6 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
SNX15Q9NRS6 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SNX15Q9NRS6 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SNX15Q9NRS6 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
SNX15Q9NRS6 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
SNX15Q9NRS6 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SNX15Q9NRS6 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SNX15Q9NRS6 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SNX15Q9NRS6 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SNX15Q9NRS6 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SNX15Q9NRS6 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SNX15Q9NRS6 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SNX15Q9NRS6 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SNX15Q9NRS6 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SNX15Q9NRS6 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SNX15Q9NRS6 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SNX15Q9NRS6 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SNX15Q9NRS6 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SNX15Q9NRS6 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SNX15Q9NRS6 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SNX15Q9NRS6 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SNX15Q9NRS6 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SNX15Q9NRS6 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SNX15Q9NRS6 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SNX15Q9NRS6 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SNX15Q9NRS6 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SNX15Q9NRS6 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SNX15Q9NRS6 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SNX15Q9NRS6 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SNX15Q9NRS6 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SNX15Q9NRS6 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SNX15Q9NRS6 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SNX15Q9NRS6 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SNX15Q9NRS6 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SNX15Q9NRS6 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SNX15Q9NRS6 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
SNX15Q9NRS6 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SNX15Q9NRS6 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SNX15Q9NRS6 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SNX15Q9NRS6 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SNX15Q9NRS6 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SNX15Q9NRS6 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SNX15Q9NRS6 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SNX15Q9NRS6 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SNX15Q9NRS6 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
SNX15Q9NRS6 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SNX15Q9NRS6 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SNX15Q9NRS6 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms