Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRF2

SH2B1, SH2B adapter protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH2B1Q9NRF2 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
SH2B1Q9NRF2 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SH2B1Q9NRF2 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
SH2B1Q9NRF2 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SH2B1Q9NRF2 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
SH2B1Q9NRF2 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SH2B1Q9NRF2 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SH2B1Q9NRF2 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC26.45■■□□□ 1.82
SH2B1Q9NRF2 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SH2B1Q9NRF2 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SH2B1Q9NRF2 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SH2B1Q9NRF2 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SH2B1Q9NRF2 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SH2B1Q9NRF2 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SH2B1Q9NRF2 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SH2B1Q9NRF2 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SH2B1Q9NRF2 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SH2B1Q9NRF2 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SH2B1Q9NRF2 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SH2B1Q9NRF2 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SH2B1Q9NRF2 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SH2B1Q9NRF2 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SH2B1Q9NRF2 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SH2B1Q9NRF2 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SH2B1Q9NRF2 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SH2B1Q9NRF2 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SH2B1Q9NRF2 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SH2B1Q9NRF2 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SH2B1Q9NRF2 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SH2B1Q9NRF2 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SH2B1Q9NRF2 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SH2B1Q9NRF2 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SH2B1Q9NRF2 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SH2B1Q9NRF2 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SH2B1Q9NRF2 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SH2B1Q9NRF2 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SH2B1Q9NRF2 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SH2B1Q9NRF2 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SH2B1Q9NRF2 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SH2B1Q9NRF2 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SH2B1Q9NRF2 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SH2B1Q9NRF2 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
SH2B1Q9NRF2 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC26.4■■□□□ 1.82
SH2B1Q9NRF2 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SH2B1Q9NRF2 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SH2B1Q9NRF2 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
SH2B1Q9NRF2 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
SH2B1Q9NRF2 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
SH2B1Q9NRF2 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
SH2B1Q9NRF2 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
SH2B1Q9NRF2 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
SH2B1Q9NRF2 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
SH2B1Q9NRF2 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SH2B1Q9NRF2 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SH2B1Q9NRF2 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SH2B1Q9NRF2 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SH2B1Q9NRF2 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SH2B1Q9NRF2 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SH2B1Q9NRF2 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SH2B1Q9NRF2 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SH2B1Q9NRF2 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SH2B1Q9NRF2 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SH2B1Q9NRF2 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SH2B1Q9NRF2 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SH2B1Q9NRF2 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
SH2B1Q9NRF2 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SH2B1Q9NRF2 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SH2B1Q9NRF2 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SH2B1Q9NRF2 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SH2B1Q9NRF2 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SH2B1Q9NRF2 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SH2B1Q9NRF2 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SH2B1Q9NRF2 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
SH2B1Q9NRF2 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SH2B1Q9NRF2 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SH2B1Q9NRF2 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SH2B1Q9NRF2 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SH2B1Q9NRF2 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SH2B1Q9NRF2 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SH2B1Q9NRF2 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SH2B1Q9NRF2 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SH2B1Q9NRF2 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SH2B1Q9NRF2 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SH2B1Q9NRF2 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SH2B1Q9NRF2 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SH2B1Q9NRF2 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SH2B1Q9NRF2 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SH2B1Q9NRF2 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SH2B1Q9NRF2 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SH2B1Q9NRF2 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SH2B1Q9NRF2 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SH2B1Q9NRF2 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SH2B1Q9NRF2 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SH2B1Q9NRF2 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
SH2B1Q9NRF2 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
SH2B1Q9NRF2 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SH2B1Q9NRF2 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SH2B1Q9NRF2 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SH2B1Q9NRF2 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
SH2B1Q9NRF2 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms