Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQV8

PRDM8, PR domain zinc finger protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 689 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM8Q9NQV8 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRDM8Q9NQV8 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRDM8Q9NQV8 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRDM8Q9NQV8 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRDM8Q9NQV8 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRDM8Q9NQV8 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRDM8Q9NQV8 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRDM8Q9NQV8 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
PRDM8Q9NQV8 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRDM8Q9NQV8 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRDM8Q9NQV8 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRDM8Q9NQV8 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRDM8Q9NQV8 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRDM8Q9NQV8 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRDM8Q9NQV8 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRDM8Q9NQV8 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRDM8Q9NQV8 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRDM8Q9NQV8 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRDM8Q9NQV8 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRDM8Q9NQV8 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRDM8Q9NQV8 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRDM8Q9NQV8 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRDM8Q9NQV8 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRDM8Q9NQV8 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
PRDM8Q9NQV8 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRDM8Q9NQV8 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRDM8Q9NQV8 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRDM8Q9NQV8 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRDM8Q9NQV8 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRDM8Q9NQV8 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRDM8Q9NQV8 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRDM8Q9NQV8 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRDM8Q9NQV8 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRDM8Q9NQV8 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRDM8Q9NQV8 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRDM8Q9NQV8 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRDM8Q9NQV8 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRDM8Q9NQV8 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRDM8Q9NQV8 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRDM8Q9NQV8 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRDM8Q9NQV8 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRDM8Q9NQV8 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRDM8Q9NQV8 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRDM8Q9NQV8 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
PRDM8Q9NQV8 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRDM8Q9NQV8 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRDM8Q9NQV8 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRDM8Q9NQV8 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PRDM8Q9NQV8 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PRDM8Q9NQV8 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PRDM8Q9NQV8 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PRDM8Q9NQV8 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PRDM8Q9NQV8 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PRDM8Q9NQV8 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PRDM8Q9NQV8 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
PRDM8Q9NQV8 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PRDM8Q9NQV8 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PRDM8Q9NQV8 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PRDM8Q9NQV8 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRDM8Q9NQV8 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRDM8Q9NQV8 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRDM8Q9NQV8 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRDM8Q9NQV8 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRDM8Q9NQV8 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRDM8Q9NQV8 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRDM8Q9NQV8 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRDM8Q9NQV8 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRDM8Q9NQV8 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRDM8Q9NQV8 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRDM8Q9NQV8 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRDM8Q9NQV8 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRDM8Q9NQV8 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRDM8Q9NQV8 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRDM8Q9NQV8 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRDM8Q9NQV8 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRDM8Q9NQV8 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRDM8Q9NQV8 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRDM8Q9NQV8 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRDM8Q9NQV8 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRDM8Q9NQV8 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
PRDM8Q9NQV8 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRDM8Q9NQV8 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
PRDM8Q9NQV8 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRDM8Q9NQV8 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRDM8Q9NQV8 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRDM8Q9NQV8 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
PRDM8Q9NQV8 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
PRDM8Q9NQV8 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRDM8Q9NQV8 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRDM8Q9NQV8 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRDM8Q9NQV8 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRDM8Q9NQV8 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
PRDM8Q9NQV8 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRDM8Q9NQV8 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRDM8Q9NQV8 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRDM8Q9NQV8 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRDM8Q9NQV8 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRDM8Q9NQV8 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
PRDM8Q9NQV8 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
PRDM8Q9NQV8 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms