Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQT4

EXOSC5, Exosome complex component RRP46, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 235 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC5Q9NQT4 WDR70-206ENST00000510699 690 ntTSL 54.71□□□□□ -1.669e-7■■■■■ 28.8
EXOSC5Q9NQT4 NEK7-205ENST00000442588 519 ntTSL 513.48□□□□□ -0.251e-7■■■■■ 28.7
EXOSC5Q9NQT4 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.31e-7■■■■■ 28.7
EXOSC5Q9NQT4 NEK7-208ENST00000544035 565 ntTSL 55.46□□□□□ -1.541e-7■■■■■ 28.7
EXOSC5Q9NQT4 NEK7-203ENST00000391974 587 ntTSL 33.64□□□□□ -1.831e-7■■■■■ 28.7
EXOSC5Q9NQT4 IQCB1-203ENST00000393650 2253 ntTSL 513.1□□□□□ -0.311e-7■■■■■ 28.7
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EXOSC5Q9NQT4 IQCB1-204ENST00000460108 988 ntTSL 59.97□□□□□ -0.811e-7■■■■■ 28.7
EXOSC5Q9NQT4 IQCB1-201ENST00000310864 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.881e-7■■■■■ 28.7
EXOSC5Q9NQT4 AC008014.1-203ENST00000611243 1569 ntTSL 1 (best) BASIC8.09□□□□□ -1.111e-6■■■■■ 28.7
EXOSC5Q9NQT4 IQCB1-207ENST00000498104 701 ntTSL 38.03□□□□□ -1.121e-7■■■■■ 28.7
EXOSC5Q9NQT4 AC009271.1-201ENST00000589440 518 ntTSL 2 BASIC9.44□□□□□ -0.96e-7■■■■■ 28.7
EXOSC5Q9NQT4 AC009271.1-202ENST00000588803 492 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.976e-7■■■■■ 28.7
EXOSC5Q9NQT4 CDYL-207ENST00000472453 1764 ntTSL 1 (best)21.87■■□□□ 1.095e-7■■■■■ 28.7
EXOSC5Q9NQT4 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.962e-6■■■■■ 28.7
EXOSC5Q9NQT4 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.85e-7■■■■■ 28.7
EXOSC5Q9NQT4 NAPB-204ENST00000468128 782 ntTSL 517.17■□□□□ 0.341e-7■■■■■ 28.7
EXOSC5Q9NQT4 IGF2BP3-213ENST00000491719 800 ntTSL 516.51■□□□□ 0.231e-11■■■■■ 28.7
EXOSC5Q9NQT4 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.199e-7■■■■■ 28.7
EXOSC5Q9NQT4 USP10-208ENST00000563386 590 ntTSL 414.93□□□□□ -0.021e-6■■■■■ 28.7
EXOSC5Q9NQT4 USP10-216ENST00000569511 571 ntTSL 514.67□□□□□ -0.061e-6■■■■■ 28.7
EXOSC5Q9NQT4 USP10-203ENST00000562092 254 ntTSL 514.67□□□□□ -0.061e-6■■■■■ 28.7
EXOSC5Q9NQT4 IGF2BP3-207ENST00000468263 706 ntTSL 214.18□□□□□ -0.141e-11■■■■■ 28.7
EXOSC5Q9NQT4 USP10-205ENST00000562743 888 ntTSL 214.17□□□□□ -0.141e-6■■■■■ 28.7
EXOSC5Q9NQT4 USP10-204ENST00000562283 569 ntTSL 413.39□□□□□ -0.271e-6■■■■■ 28.7
EXOSC5Q9NQT4 IGF2BP3-206ENST00000468005 2948 ntTSL 512.35□□□□□ -0.431e-11■■■■■ 28.7
EXOSC5Q9NQT4 IGF2BP3-210ENST00000476938 500 ntTSL 212.24□□□□□ -0.451e-11■■■■■ 28.7
EXOSC5Q9NQT4 ZNF148-205ENST00000484491 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.69e-7■■■■■ 28.7
EXOSC5Q9NQT4 ZNF148-206ENST00000485866 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.629e-7■■■■■ 28.7
EXOSC5Q9NQT4 TNRC6A-211ENST00000566108 454 ntTSL 310.11□□□□□ -0.794e-7■■■■■ 28.7
EXOSC5Q9NQT4 CHD2-223ENST00000636306 1755 ntTSL 59.45□□□□□ -0.93e-6■■■■■ 28.7
EXOSC5Q9NQT4 IGF2BP3-202ENST00000421467 2988 ntTSL 59.07□□□□□ -0.961e-11■■■■■ 28.7
EXOSC5Q9NQT4 ZNF148-207ENST00000492394 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.969e-7■■■■■ 28.7
EXOSC5Q9NQT4 CDYL-201ENST00000328908 3419 ntTSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -15e-7■■■■■ 28.7
EXOSC5Q9NQT4 CHD2-201ENST00000394196 9363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.45□□□□□ -1.061e-6■■■■■ 28.7
EXOSC5Q9NQT4 CDYL-208ENST00000483019 773 ntTSL 27.97□□□□□ -1.135e-7■■■■■ 28.7
EXOSC5Q9NQT4 NAPB-205ENST00000472855 1651 ntTSL 27.86□□□□□ -1.151e-7■■■■■ 28.7
EXOSC5Q9NQT4 CHD2-226ENST00000636881 3545 ntTSL 57.54□□□□□ -1.21e-6■■■■■ 28.7
EXOSC5Q9NQT4 CDYL-204ENST00000440139 690 ntTSL 37.03□□□□□ -1.285e-7■■■■■ 28.7
EXOSC5Q9NQT4 ZNF148-201ENST00000360647 9651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.329e-7■■■■■ 28.7
EXOSC5Q9NQT4 CHD2-208ENST00000626874 7764 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.381e-6■■■■■ 28.7
EXOSC5Q9NQT4 IGF2BP3-201ENST00000258729 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.451e-11■■■■■ 28.7
EXOSC5Q9NQT4 CHD2-221ENST00000635856 4236 ntTSL 55.75□□□□□ -1.491e-6■■■■■ 28.7
EXOSC5Q9NQT4 CDYL-209ENST00000491864 614 ntTSL 55.51□□□□□ -1.535e-7■■■■■ 28.7
EXOSC5Q9NQT4 C16orf72-202ENST00000574285 10359 ntTSL 25.05□□□□□ -1.62e-6■■■■■ 28.7
EXOSC5Q9NQT4 CHD2-227ENST00000637572 4452 ntTSL 54.77□□□□□ -1.651e-6■■■■■ 28.7
EXOSC5Q9NQT4 DNAH14-210ENST00000439375 13548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.19□□□□□ -2.062e-6■■■■■ 28.7
EXOSC5Q9NQT4 PPP1R12A-208ENST00000547330 2275 ntTSL 1 (best)12.5□□□□□ -0.411e-6■■■■■ 28.7
EXOSC5Q9NQT4 PPP1R12A-201ENST00000261207 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.51e-6■■■■■ 28.7
EXOSC5Q9NQT4 PPP1R12A-203ENST00000450142 5721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.71e-6■■■■■ 28.7
EXOSC5Q9NQT4 PPP1R12A-202ENST00000437004 4639 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.781e-6■■■■■ 28.7
EXOSC5Q9NQT4 PPP1R12A-213ENST00000550107 2925 ntTSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.071e-6■■■■■ 28.7
EXOSC5Q9NQT4 PPP1R12A-209ENST00000548318 582 ntTSL 33.61□□□□□ -1.831e-6■■■■■ 28.7
EXOSC5Q9NQT4 PPP1R12A-216ENST00000550510 631 ntTSL 53.47□□□□□ -1.851e-6■■■■■ 28.7
EXOSC5Q9NQT4 PPP1R12A-204ENST00000546369 2977 ntTSL 2 BASIC3.21□□□□□ -1.91e-6■■■■■ 28.7
EXOSC5Q9NQT4 DTL-201ENST00000366991 4573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.623e-7■■■■■ 28.7
EXOSC5Q9NQT4 DTL-206ENST00000542077 4471 ntTSL 2 BASIC8.45□□□□□ -1.063e-7■■■■■ 28.7
EXOSC5Q9NQT4 DTL-203ENST00000475419 3662 ntTSL 24.98□□□□□ -1.613e-7■■■■■ 28.7
EXOSC5Q9NQT4 DTL-202ENST00000463791 557 ntTSL 24.46□□□□□ -1.73e-7■■■■■ 28.7
EXOSC5Q9NQT4 DTL-204ENST00000489149 815 ntTSL 23.96□□□□□ -1.783e-7■■■■■ 28.7
EXOSC5Q9NQT4 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.924e-7■■■■■ 28.7
EXOSC5Q9NQT4 TOP2B-203ENST00000424225 3525 ntTSL 1 (best)11.24□□□□□ -0.614e-7■■■■■ 28.7
EXOSC5Q9NQT4 TOP2B-201ENST00000264331 5358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.64e-7■■■■■ 28.7
EXOSC5Q9NQT4 WDHD1-202ENST00000420358 3722 ntTSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.281e-6■■■■■ 28.6
EXOSC5Q9NQT4 WDHD1-201ENST00000360586 5996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.691e-6■■■■■ 28.6
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EXOSC5Q9NQT4 AC112178.1-202ENST00000446720 427 ntTSL 34.18□□□□□ -1.746e-7■■■■■ 28.6
EXOSC5Q9NQT4 LINC00470-210ENST00000584090 1334 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.616e-7■■■■■ 28.6
EXOSC5Q9NQT4 NDC1-201ENST00000371429 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.289e-7■■■■■ 28.6
EXOSC5Q9NQT4 NUBPL-208ENST00000550649 557 ntTSL 515.13■□□□□ 0.011e-6■■■■■ 28.5
EXOSC5Q9NQT4 NUBPL-207ENST00000550355 596 ntTSL 415.13■□□□□ 0.011e-6■■■■■ 28.5
EXOSC5Q9NQT4 NUBPL-204ENST00000548937 578 ntTSL 313.77□□□□□ -0.211e-6■■■■■ 28.5
EXOSC5Q9NQT4 NUBPL-211ENST00000552489 541 ntTSL 413.49□□□□□ -0.251e-6■■■■■ 28.5
EXOSC5Q9NQT4 NUBPL-201ENST00000281081 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.361e-6■■■■■ 28.5
EXOSC5Q9NQT4 NUBPL-203ENST00000547839 2001 ntTSL 27.12□□□□□ -1.271e-6■■■■■ 28.5
EXOSC5Q9NQT4 NUBPL-210ENST00000551314 567 ntTSL 46.24□□□□□ -1.411e-6■■■■■ 28.5
EXOSC5Q9NQT4 NUBPL-205ENST00000549838 556 ntTSL 51.91□□□□□ -2.11e-6■■■■■ 28.5
EXOSC5Q9NQT4 GTPBP10-204ENST00000417207 775 ntTSL 57.23□□□□□ -1.255e-7■■■■■ 28.5
EXOSC5Q9NQT4 GTPBP10-209ENST00000453512 636 ntTSL 56.81□□□□□ -1.325e-7■■■■■ 28.5
EXOSC5Q9NQT4 GTPBP10-205ENST00000421719 686 ntTSL 56.81□□□□□ -1.325e-7■■■■■ 28.5
EXOSC5Q9NQT4 GTPBP10-207ENST00000439832 545 ntTSL 26.77□□□□□ -1.335e-7■■■■■ 28.5
EXOSC5Q9NQT4 GTPBP10-211ENST00000474503 715 ntTSL 56.65□□□□□ -1.345e-7■■■■■ 28.5
EXOSC5Q9NQT4 GTPBP10-202ENST00000257659 1740 ntTSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.45e-7■■■■■ 28.5
EXOSC5Q9NQT4 GTPBP10-203ENST00000380058 6913 ntTSL 1 (best)6.18□□□□□ -1.425e-7■■■■■ 28.5
EXOSC5Q9NQT4 GTPBP10-201ENST00000222511 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.575e-7■■■■■ 28.5
EXOSC5Q9NQT4 GTPBP10-208ENST00000450619 856 ntTSL 55.09□□□□□ -1.595e-7■■■■■ 28.5
EXOSC5Q9NQT4 GTPBP10-206ENST00000426366 778 ntTSL 55.09□□□□□ -1.595e-7■■■■■ 28.5
EXOSC5Q9NQT4 PTH2R-202ENST00000419079 811 ntTSL 25.18□□□□□ -1.589e-7■■■■■ 28.5
EXOSC5Q9NQT4 WDR44-203ENST00000371825 4029 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.183e-6■■■■■ 28.5
EXOSC5Q9NQT4 WDR44-201ENST00000254029 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.283e-6■■■■■ 28.5
EXOSC5Q9NQT4 WDR44-202ENST00000371822 3877 ntTSL 2 BASIC6.73□□□□□ -1.333e-6■■■■■ 28.5
EXOSC5Q9NQT4 WDR44-204ENST00000371848 2844 ntTSL 1 (best)3.33□□□□□ -1.883e-6■■■■■ 28.5
EXOSC5Q9NQT4 GRB10-212ENST00000439044 733 ntTSL 518.17■□□□□ 0.56e-7■■■■■ 28.5
EXOSC5Q9NQT4 CCDC18-AS1-219ENST00000451302 1212 ntTSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.599e-7■■■■■ 28.5
EXOSC5Q9NQT4 CCDC18-AS1-204ENST00000415150 448 ntTSL 39.39□□□□□ -0.919e-7■■■■■ 28.5
EXOSC5Q9NQT4 CCDC18-AS1-207ENST00000427669 383 ntTSL 38.47□□□□□ -1.059e-7■■■■■ 28.5
EXOSC5Q9NQT4 CCDC18-AS1-222ENST00000457025 413 ntTSL 58.47□□□□□ -1.059e-7■■■■■ 28.5
EXOSC5Q9NQT4 CCDC18-AS1-206ENST00000424517 270 ntTSL 58.47□□□□□ -1.059e-7■■■■■ 28.5
EXOSC5Q9NQT4 CCDC18-AS1-202ENST00000413606 770 ntTSL 37.23□□□□□ -1.259e-7■■■■■ 28.5
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