Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQH7

XPNPEP3, Probable Xaa-Pro aminopeptidase 3, humanhuman

Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XPNPEP3Q9NQH7 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
XPNPEP3Q9NQH7 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
XPNPEP3Q9NQH7 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
XPNPEP3Q9NQH7 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
XPNPEP3Q9NQH7 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
XPNPEP3Q9NQH7 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
XPNPEP3Q9NQH7 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
XPNPEP3Q9NQH7 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
XPNPEP3Q9NQH7 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
XPNPEP3Q9NQH7 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
XPNPEP3Q9NQH7 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
XPNPEP3Q9NQH7 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
XPNPEP3Q9NQH7 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
XPNPEP3Q9NQH7 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
XPNPEP3Q9NQH7 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
XPNPEP3Q9NQH7 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC25.32■■□□□ 1.64
XPNPEP3Q9NQH7 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
XPNPEP3Q9NQH7 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
XPNPEP3Q9NQH7 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
XPNPEP3Q9NQH7 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
XPNPEP3Q9NQH7 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
XPNPEP3Q9NQH7 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
XPNPEP3Q9NQH7 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
XPNPEP3Q9NQH7 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
XPNPEP3Q9NQH7 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC25.31■■□□□ 1.64
XPNPEP3Q9NQH7 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
XPNPEP3Q9NQH7 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
XPNPEP3Q9NQH7 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
XPNPEP3Q9NQH7 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
XPNPEP3Q9NQH7 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
XPNPEP3Q9NQH7 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
XPNPEP3Q9NQH7 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC25.3■■□□□ 1.64
XPNPEP3Q9NQH7 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
XPNPEP3Q9NQH7 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
XPNPEP3Q9NQH7 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
XPNPEP3Q9NQH7 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
XPNPEP3Q9NQH7 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
XPNPEP3Q9NQH7 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
XPNPEP3Q9NQH7 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
XPNPEP3Q9NQH7 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
XPNPEP3Q9NQH7 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
XPNPEP3Q9NQH7 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
XPNPEP3Q9NQH7 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
XPNPEP3Q9NQH7 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
XPNPEP3Q9NQH7 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
XPNPEP3Q9NQH7 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
XPNPEP3Q9NQH7 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
XPNPEP3Q9NQH7 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
XPNPEP3Q9NQH7 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
XPNPEP3Q9NQH7 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
XPNPEP3Q9NQH7 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
XPNPEP3Q9NQH7 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
XPNPEP3Q9NQH7 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
XPNPEP3Q9NQH7 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
XPNPEP3Q9NQH7 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
XPNPEP3Q9NQH7 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
XPNPEP3Q9NQH7 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
XPNPEP3Q9NQH7 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
XPNPEP3Q9NQH7 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
XPNPEP3Q9NQH7 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
XPNPEP3Q9NQH7 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
XPNPEP3Q9NQH7 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
XPNPEP3Q9NQH7 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
XPNPEP3Q9NQH7 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
XPNPEP3Q9NQH7 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
XPNPEP3Q9NQH7 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
XPNPEP3Q9NQH7 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
XPNPEP3Q9NQH7 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
XPNPEP3Q9NQH7 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
XPNPEP3Q9NQH7 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
XPNPEP3Q9NQH7 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
XPNPEP3Q9NQH7 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
XPNPEP3Q9NQH7 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
XPNPEP3Q9NQH7 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
XPNPEP3Q9NQH7 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
XPNPEP3Q9NQH7 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
XPNPEP3Q9NQH7 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
XPNPEP3Q9NQH7 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
XPNPEP3Q9NQH7 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
XPNPEP3Q9NQH7 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
XPNPEP3Q9NQH7 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
XPNPEP3Q9NQH7 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
XPNPEP3Q9NQH7 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
XPNPEP3Q9NQH7 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
XPNPEP3Q9NQH7 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
XPNPEP3Q9NQH7 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
XPNPEP3Q9NQH7 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
XPNPEP3Q9NQH7 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
XPNPEP3Q9NQH7 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
XPNPEP3Q9NQH7 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
XPNPEP3Q9NQH7 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
XPNPEP3Q9NQH7 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
XPNPEP3Q9NQH7 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
XPNPEP3Q9NQH7 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
XPNPEP3Q9NQH7 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
XPNPEP3Q9NQH7 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
XPNPEP3Q9NQH7 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
XPNPEP3Q9NQH7 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
XPNPEP3Q9NQH7 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
XPNPEP3Q9NQH7 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms