Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP58

ABCB6, ATP-binding cassette sub-family B member 6, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 842 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCB6Q9NP58 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ABCB6Q9NP58 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ABCB6Q9NP58 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
ABCB6Q9NP58 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
ABCB6Q9NP58 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ABCB6Q9NP58 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ABCB6Q9NP58 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ABCB6Q9NP58 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ABCB6Q9NP58 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ABCB6Q9NP58 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ABCB6Q9NP58 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ABCB6Q9NP58 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ABCB6Q9NP58 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ABCB6Q9NP58 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ABCB6Q9NP58 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ABCB6Q9NP58 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
ABCB6Q9NP58 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ABCB6Q9NP58 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ABCB6Q9NP58 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ABCB6Q9NP58 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ABCB6Q9NP58 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ABCB6Q9NP58 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ABCB6Q9NP58 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ABCB6Q9NP58 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ABCB6Q9NP58 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ABCB6Q9NP58 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
ABCB6Q9NP58 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ABCB6Q9NP58 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ABCB6Q9NP58 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ABCB6Q9NP58 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ABCB6Q9NP58 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ABCB6Q9NP58 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ABCB6Q9NP58 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ABCB6Q9NP58 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ABCB6Q9NP58 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ABCB6Q9NP58 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ABCB6Q9NP58 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ABCB6Q9NP58 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ABCB6Q9NP58 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
ABCB6Q9NP58 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ABCB6Q9NP58 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ABCB6Q9NP58 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
ABCB6Q9NP58 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ABCB6Q9NP58 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ABCB6Q9NP58 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ABCB6Q9NP58 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ABCB6Q9NP58 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ABCB6Q9NP58 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ABCB6Q9NP58 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ABCB6Q9NP58 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ABCB6Q9NP58 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ABCB6Q9NP58 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ABCB6Q9NP58 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ABCB6Q9NP58 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ABCB6Q9NP58 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ABCB6Q9NP58 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
ABCB6Q9NP58 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ABCB6Q9NP58 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ABCB6Q9NP58 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ABCB6Q9NP58 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ABCB6Q9NP58 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ABCB6Q9NP58 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ABCB6Q9NP58 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ABCB6Q9NP58 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
ABCB6Q9NP58 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ABCB6Q9NP58 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ABCB6Q9NP58 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ABCB6Q9NP58 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ABCB6Q9NP58 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ABCB6Q9NP58 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ABCB6Q9NP58 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ABCB6Q9NP58 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ABCB6Q9NP58 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ABCB6Q9NP58 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ABCB6Q9NP58 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ABCB6Q9NP58 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ABCB6Q9NP58 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ABCB6Q9NP58 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ABCB6Q9NP58 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ABCB6Q9NP58 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ABCB6Q9NP58 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ABCB6Q9NP58 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ABCB6Q9NP58 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ABCB6Q9NP58 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ABCB6Q9NP58 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ABCB6Q9NP58 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ABCB6Q9NP58 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ABCB6Q9NP58 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ABCB6Q9NP58 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ABCB6Q9NP58 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ABCB6Q9NP58 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ABCB6Q9NP58 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ABCB6Q9NP58 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ABCB6Q9NP58 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ABCB6Q9NP58 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ABCB6Q9NP58 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ABCB6Q9NP58 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ABCB6Q9NP58 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
ABCB6Q9NP58 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ABCB6Q9NP58 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms