Protein–RNA interactions for Protein: Q9H9K5

ERVMER34-1, Endogenous retrovirus group MER34 member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVMER34-1Q9H9K5 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ERVMER34-1Q9H9K5 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ERVMER34-1Q9H9K5 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ERVMER34-1Q9H9K5 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ERVMER34-1Q9H9K5 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ERVMER34-1Q9H9K5 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ERVMER34-1Q9H9K5 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ERVMER34-1Q9H9K5 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ERVMER34-1Q9H9K5 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ERVMER34-1Q9H9K5 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
ERVMER34-1Q9H9K5 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ERVMER34-1Q9H9K5 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ERVMER34-1Q9H9K5 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ERVMER34-1Q9H9K5 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ERVMER34-1Q9H9K5 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ERVMER34-1Q9H9K5 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ERVMER34-1Q9H9K5 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
ERVMER34-1Q9H9K5 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ERVMER34-1Q9H9K5 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
ERVMER34-1Q9H9K5 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ERVMER34-1Q9H9K5 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ERVMER34-1Q9H9K5 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ERVMER34-1Q9H9K5 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ERVMER34-1Q9H9K5 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ERVMER34-1Q9H9K5 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ERVMER34-1Q9H9K5 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ERVMER34-1Q9H9K5 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ERVMER34-1Q9H9K5 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ERVMER34-1Q9H9K5 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ERVMER34-1Q9H9K5 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ERVMER34-1Q9H9K5 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
ERVMER34-1Q9H9K5 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ERVMER34-1Q9H9K5 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ERVMER34-1Q9H9K5 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ERVMER34-1Q9H9K5 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
ERVMER34-1Q9H9K5 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ERVMER34-1Q9H9K5 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ERVMER34-1Q9H9K5 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ERVMER34-1Q9H9K5 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ERVMER34-1Q9H9K5 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
ERVMER34-1Q9H9K5 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ERVMER34-1Q9H9K5 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ERVMER34-1Q9H9K5 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ERVMER34-1Q9H9K5 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ERVMER34-1Q9H9K5 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
ERVMER34-1Q9H9K5 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ERVMER34-1Q9H9K5 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ERVMER34-1Q9H9K5 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ERVMER34-1Q9H9K5 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ERVMER34-1Q9H9K5 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ERVMER34-1Q9H9K5 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ERVMER34-1Q9H9K5 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ERVMER34-1Q9H9K5 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ERVMER34-1Q9H9K5 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ERVMER34-1Q9H9K5 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ERVMER34-1Q9H9K5 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ERVMER34-1Q9H9K5 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ERVMER34-1Q9H9K5 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ERVMER34-1Q9H9K5 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ERVMER34-1Q9H9K5 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ERVMER34-1Q9H9K5 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ERVMER34-1Q9H9K5 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
ERVMER34-1Q9H9K5 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ERVMER34-1Q9H9K5 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ERVMER34-1Q9H9K5 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ERVMER34-1Q9H9K5 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ERVMER34-1Q9H9K5 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ERVMER34-1Q9H9K5 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ERVMER34-1Q9H9K5 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ERVMER34-1Q9H9K5 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
ERVMER34-1Q9H9K5 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ERVMER34-1Q9H9K5 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
ERVMER34-1Q9H9K5 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ERVMER34-1Q9H9K5 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ERVMER34-1Q9H9K5 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
ERVMER34-1Q9H9K5 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ERVMER34-1Q9H9K5 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ERVMER34-1Q9H9K5 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ERVMER34-1Q9H9K5 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ERVMER34-1Q9H9K5 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ERVMER34-1Q9H9K5 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ERVMER34-1Q9H9K5 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ERVMER34-1Q9H9K5 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ERVMER34-1Q9H9K5 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ERVMER34-1Q9H9K5 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ERVMER34-1Q9H9K5 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ERVMER34-1Q9H9K5 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ERVMER34-1Q9H9K5 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ERVMER34-1Q9H9K5 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ERVMER34-1Q9H9K5 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ERVMER34-1Q9H9K5 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ERVMER34-1Q9H9K5 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ERVMER34-1Q9H9K5 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ERVMER34-1Q9H9K5 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ERVMER34-1Q9H9K5 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ERVMER34-1Q9H9K5 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ERVMER34-1Q9H9K5 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
ERVMER34-1Q9H9K5 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
ERVMER34-1Q9H9K5 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
ERVMER34-1Q9H9K5 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms