Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7U1

CCSER2, Serine-rich coiled-coil domain-containing protein 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSER2Q9H7U1 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
CCSER2Q9H7U1 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCSER2Q9H7U1 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
CCSER2Q9H7U1 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CCSER2Q9H7U1 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CCSER2Q9H7U1 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCSER2Q9H7U1 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCSER2Q9H7U1 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCSER2Q9H7U1 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCSER2Q9H7U1 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCSER2Q9H7U1 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCSER2Q9H7U1 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCSER2Q9H7U1 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCSER2Q9H7U1 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CCSER2Q9H7U1 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCSER2Q9H7U1 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCSER2Q9H7U1 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCSER2Q9H7U1 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCSER2Q9H7U1 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CCSER2Q9H7U1 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCSER2Q9H7U1 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CCSER2Q9H7U1 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCSER2Q9H7U1 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCSER2Q9H7U1 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCSER2Q9H7U1 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCSER2Q9H7U1 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCSER2Q9H7U1 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCSER2Q9H7U1 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCSER2Q9H7U1 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCSER2Q9H7U1 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCSER2Q9H7U1 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCSER2Q9H7U1 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CCSER2Q9H7U1 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CCSER2Q9H7U1 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CCSER2Q9H7U1 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CCSER2Q9H7U1 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CCSER2Q9H7U1 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCSER2Q9H7U1 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCSER2Q9H7U1 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCSER2Q9H7U1 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCSER2Q9H7U1 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
CCSER2Q9H7U1 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCSER2Q9H7U1 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCSER2Q9H7U1 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCSER2Q9H7U1 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCSER2Q9H7U1 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCSER2Q9H7U1 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCSER2Q9H7U1 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCSER2Q9H7U1 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CCSER2Q9H7U1 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCSER2Q9H7U1 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CCSER2Q9H7U1 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCSER2Q9H7U1 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCSER2Q9H7U1 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCSER2Q9H7U1 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCSER2Q9H7U1 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCSER2Q9H7U1 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCSER2Q9H7U1 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCSER2Q9H7U1 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCSER2Q9H7U1 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
CCSER2Q9H7U1 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCSER2Q9H7U1 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCSER2Q9H7U1 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCSER2Q9H7U1 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCSER2Q9H7U1 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCSER2Q9H7U1 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCSER2Q9H7U1 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCSER2Q9H7U1 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CCSER2Q9H7U1 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CCSER2Q9H7U1 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCSER2Q9H7U1 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCSER2Q9H7U1 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCSER2Q9H7U1 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCSER2Q9H7U1 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCSER2Q9H7U1 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCSER2Q9H7U1 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCSER2Q9H7U1 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCSER2Q9H7U1 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCSER2Q9H7U1 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCSER2Q9H7U1 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCSER2Q9H7U1 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCSER2Q9H7U1 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCSER2Q9H7U1 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCSER2Q9H7U1 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCSER2Q9H7U1 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCSER2Q9H7U1 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCSER2Q9H7U1 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCSER2Q9H7U1 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCSER2Q9H7U1 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCSER2Q9H7U1 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCSER2Q9H7U1 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCSER2Q9H7U1 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCSER2Q9H7U1 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCSER2Q9H7U1 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCSER2Q9H7U1 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCSER2Q9H7U1 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
CCSER2Q9H7U1 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCSER2Q9H7U1 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCSER2Q9H7U1 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCSER2Q9H7U1 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
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