Protein–RNA interactions for Protein: Q9H799

C5orf42, Protein JBTS17, humanhuman

Predictions only

Length 3,197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C5orf42Q9H799 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC23.65■■□□□ 1.38
C5orf42Q9H799 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
C5orf42Q9H799 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC23.65■■□□□ 1.38
C5orf42Q9H799 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
C5orf42Q9H799 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
C5orf42Q9H799 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
C5orf42Q9H799 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
C5orf42Q9H799 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
C5orf42Q9H799 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
C5orf42Q9H799 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC23.64■■□□□ 1.38
C5orf42Q9H799 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
C5orf42Q9H799 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
C5orf42Q9H799 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
C5orf42Q9H799 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
C5orf42Q9H799 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.38
C5orf42Q9H799 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
C5orf42Q9H799 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
C5orf42Q9H799 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
C5orf42Q9H799 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
C5orf42Q9H799 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
C5orf42Q9H799 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
C5orf42Q9H799 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
C5orf42Q9H799 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
C5orf42Q9H799 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
C5orf42Q9H799 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
C5orf42Q9H799 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
C5orf42Q9H799 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
C5orf42Q9H799 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
C5orf42Q9H799 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
C5orf42Q9H799 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
C5orf42Q9H799 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
C5orf42Q9H799 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
C5orf42Q9H799 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC23.62■■□□□ 1.37
C5orf42Q9H799 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
C5orf42Q9H799 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
C5orf42Q9H799 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
C5orf42Q9H799 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
C5orf42Q9H799 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
C5orf42Q9H799 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
C5orf42Q9H799 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
C5orf42Q9H799 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
C5orf42Q9H799 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.61■■□□□ 1.37
C5orf42Q9H799 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
C5orf42Q9H799 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
C5orf42Q9H799 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
C5orf42Q9H799 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
C5orf42Q9H799 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
C5orf42Q9H799 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
C5orf42Q9H799 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
C5orf42Q9H799 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
C5orf42Q9H799 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
C5orf42Q9H799 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
C5orf42Q9H799 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
C5orf42Q9H799 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
C5orf42Q9H799 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
C5orf42Q9H799 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
C5orf42Q9H799 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
C5orf42Q9H799 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
C5orf42Q9H799 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
C5orf42Q9H799 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
C5orf42Q9H799 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
C5orf42Q9H799 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
C5orf42Q9H799 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
C5orf42Q9H799 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
C5orf42Q9H799 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
C5orf42Q9H799 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
C5orf42Q9H799 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
C5orf42Q9H799 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
C5orf42Q9H799 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
C5orf42Q9H799 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
C5orf42Q9H799 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
C5orf42Q9H799 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
C5orf42Q9H799 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
C5orf42Q9H799 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
C5orf42Q9H799 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
C5orf42Q9H799 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
C5orf42Q9H799 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
C5orf42Q9H799 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
C5orf42Q9H799 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
C5orf42Q9H799 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
C5orf42Q9H799 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
C5orf42Q9H799 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
C5orf42Q9H799 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
C5orf42Q9H799 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
C5orf42Q9H799 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
C5orf42Q9H799 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
C5orf42Q9H799 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
C5orf42Q9H799 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
C5orf42Q9H799 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
C5orf42Q9H799 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
C5orf42Q9H799 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
C5orf42Q9H799 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
C5orf42Q9H799 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
C5orf42Q9H799 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
C5orf42Q9H799 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
C5orf42Q9H799 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
C5orf42Q9H799 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
C5orf42Q9H799 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
C5orf42Q9H799 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
C5orf42Q9H799 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms