Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6U6

BCAS3, Breast carcinoma-amplified sequence 3, humanhuman

Predictions only

Length 928 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCAS3Q9H6U6 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
BCAS3Q9H6U6 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
BCAS3Q9H6U6 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
BCAS3Q9H6U6 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
BCAS3Q9H6U6 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
BCAS3Q9H6U6 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
BCAS3Q9H6U6 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
BCAS3Q9H6U6 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
BCAS3Q9H6U6 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
BCAS3Q9H6U6 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
BCAS3Q9H6U6 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
BCAS3Q9H6U6 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
BCAS3Q9H6U6 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
BCAS3Q9H6U6 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
BCAS3Q9H6U6 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
BCAS3Q9H6U6 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
BCAS3Q9H6U6 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
BCAS3Q9H6U6 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
BCAS3Q9H6U6 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
BCAS3Q9H6U6 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
BCAS3Q9H6U6 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
BCAS3Q9H6U6 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
BCAS3Q9H6U6 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
BCAS3Q9H6U6 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
BCAS3Q9H6U6 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
BCAS3Q9H6U6 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
BCAS3Q9H6U6 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
BCAS3Q9H6U6 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
BCAS3Q9H6U6 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
BCAS3Q9H6U6 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
BCAS3Q9H6U6 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
BCAS3Q9H6U6 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
BCAS3Q9H6U6 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
BCAS3Q9H6U6 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
BCAS3Q9H6U6 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
BCAS3Q9H6U6 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
BCAS3Q9H6U6 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
BCAS3Q9H6U6 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
BCAS3Q9H6U6 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
BCAS3Q9H6U6 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
BCAS3Q9H6U6 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
BCAS3Q9H6U6 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
BCAS3Q9H6U6 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
BCAS3Q9H6U6 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
BCAS3Q9H6U6 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
BCAS3Q9H6U6 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
BCAS3Q9H6U6 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
BCAS3Q9H6U6 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
BCAS3Q9H6U6 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
BCAS3Q9H6U6 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
BCAS3Q9H6U6 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
BCAS3Q9H6U6 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
BCAS3Q9H6U6 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
BCAS3Q9H6U6 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
BCAS3Q9H6U6 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
BCAS3Q9H6U6 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
BCAS3Q9H6U6 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
BCAS3Q9H6U6 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
BCAS3Q9H6U6 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
BCAS3Q9H6U6 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
BCAS3Q9H6U6 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
BCAS3Q9H6U6 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
BCAS3Q9H6U6 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
BCAS3Q9H6U6 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
BCAS3Q9H6U6 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
BCAS3Q9H6U6 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
BCAS3Q9H6U6 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
BCAS3Q9H6U6 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
BCAS3Q9H6U6 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
BCAS3Q9H6U6 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
BCAS3Q9H6U6 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
BCAS3Q9H6U6 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
BCAS3Q9H6U6 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
BCAS3Q9H6U6 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
BCAS3Q9H6U6 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
BCAS3Q9H6U6 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
BCAS3Q9H6U6 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
BCAS3Q9H6U6 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
BCAS3Q9H6U6 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
BCAS3Q9H6U6 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
BCAS3Q9H6U6 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
BCAS3Q9H6U6 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
BCAS3Q9H6U6 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
BCAS3Q9H6U6 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
BCAS3Q9H6U6 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
BCAS3Q9H6U6 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
BCAS3Q9H6U6 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
BCAS3Q9H6U6 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
BCAS3Q9H6U6 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
BCAS3Q9H6U6 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
BCAS3Q9H6U6 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
BCAS3Q9H6U6 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
BCAS3Q9H6U6 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
BCAS3Q9H6U6 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
BCAS3Q9H6U6 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
BCAS3Q9H6U6 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
BCAS3Q9H6U6 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
BCAS3Q9H6U6 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
BCAS3Q9H6U6 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
BCAS3Q9H6U6 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms