Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4F8

SMOC1, SPARC-related modular calcium-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 434 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMOC1Q9H4F8 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SMOC1Q9H4F8 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SMOC1Q9H4F8 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SMOC1Q9H4F8 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
SMOC1Q9H4F8 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SMOC1Q9H4F8 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SMOC1Q9H4F8 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SMOC1Q9H4F8 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SMOC1Q9H4F8 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SMOC1Q9H4F8 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SMOC1Q9H4F8 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SMOC1Q9H4F8 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SMOC1Q9H4F8 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SMOC1Q9H4F8 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SMOC1Q9H4F8 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SMOC1Q9H4F8 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SMOC1Q9H4F8 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SMOC1Q9H4F8 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SMOC1Q9H4F8 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SMOC1Q9H4F8 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SMOC1Q9H4F8 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SMOC1Q9H4F8 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SMOC1Q9H4F8 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SMOC1Q9H4F8 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SMOC1Q9H4F8 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SMOC1Q9H4F8 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SMOC1Q9H4F8 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
SMOC1Q9H4F8 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SMOC1Q9H4F8 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SMOC1Q9H4F8 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SMOC1Q9H4F8 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SMOC1Q9H4F8 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SMOC1Q9H4F8 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
SMOC1Q9H4F8 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
SMOC1Q9H4F8 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
SMOC1Q9H4F8 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SMOC1Q9H4F8 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SMOC1Q9H4F8 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
SMOC1Q9H4F8 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SMOC1Q9H4F8 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SMOC1Q9H4F8 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SMOC1Q9H4F8 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
SMOC1Q9H4F8 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SMOC1Q9H4F8 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SMOC1Q9H4F8 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SMOC1Q9H4F8 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SMOC1Q9H4F8 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SMOC1Q9H4F8 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SMOC1Q9H4F8 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SMOC1Q9H4F8 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
SMOC1Q9H4F8 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SMOC1Q9H4F8 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SMOC1Q9H4F8 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
SMOC1Q9H4F8 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SMOC1Q9H4F8 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SMOC1Q9H4F8 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SMOC1Q9H4F8 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
SMOC1Q9H4F8 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SMOC1Q9H4F8 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SMOC1Q9H4F8 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SMOC1Q9H4F8 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SMOC1Q9H4F8 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SMOC1Q9H4F8 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SMOC1Q9H4F8 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SMOC1Q9H4F8 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SMOC1Q9H4F8 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SMOC1Q9H4F8 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SMOC1Q9H4F8 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SMOC1Q9H4F8 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SMOC1Q9H4F8 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
SMOC1Q9H4F8 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SMOC1Q9H4F8 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SMOC1Q9H4F8 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SMOC1Q9H4F8 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SMOC1Q9H4F8 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SMOC1Q9H4F8 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SMOC1Q9H4F8 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SMOC1Q9H4F8 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
SMOC1Q9H4F8 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SMOC1Q9H4F8 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SMOC1Q9H4F8 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SMOC1Q9H4F8 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SMOC1Q9H4F8 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SMOC1Q9H4F8 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SMOC1Q9H4F8 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SMOC1Q9H4F8 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SMOC1Q9H4F8 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SMOC1Q9H4F8 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SMOC1Q9H4F8 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SMOC1Q9H4F8 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
SMOC1Q9H4F8 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
SMOC1Q9H4F8 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
SMOC1Q9H4F8 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
SMOC1Q9H4F8 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
SMOC1Q9H4F8 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SMOC1Q9H4F8 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SMOC1Q9H4F8 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SMOC1Q9H4F8 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SMOC1Q9H4F8 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SMOC1Q9H4F8 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms