Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4E7

DEF6, Differentially expressed in FDCP 6 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 631 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEF6Q9H4E7 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
DEF6Q9H4E7 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
DEF6Q9H4E7 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
DEF6Q9H4E7 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
DEF6Q9H4E7 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
DEF6Q9H4E7 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
DEF6Q9H4E7 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
DEF6Q9H4E7 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
DEF6Q9H4E7 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
DEF6Q9H4E7 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
DEF6Q9H4E7 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
DEF6Q9H4E7 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
DEF6Q9H4E7 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
DEF6Q9H4E7 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
DEF6Q9H4E7 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
DEF6Q9H4E7 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
DEF6Q9H4E7 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
DEF6Q9H4E7 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
DEF6Q9H4E7 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
DEF6Q9H4E7 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
DEF6Q9H4E7 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
DEF6Q9H4E7 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
DEF6Q9H4E7 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
DEF6Q9H4E7 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
DEF6Q9H4E7 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
DEF6Q9H4E7 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
DEF6Q9H4E7 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
DEF6Q9H4E7 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
DEF6Q9H4E7 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
DEF6Q9H4E7 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
DEF6Q9H4E7 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
DEF6Q9H4E7 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
DEF6Q9H4E7 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
DEF6Q9H4E7 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
DEF6Q9H4E7 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
DEF6Q9H4E7 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
DEF6Q9H4E7 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
DEF6Q9H4E7 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
DEF6Q9H4E7 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
DEF6Q9H4E7 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
DEF6Q9H4E7 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
DEF6Q9H4E7 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
DEF6Q9H4E7 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
DEF6Q9H4E7 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
DEF6Q9H4E7 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
DEF6Q9H4E7 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
DEF6Q9H4E7 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
DEF6Q9H4E7 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
DEF6Q9H4E7 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
DEF6Q9H4E7 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
DEF6Q9H4E7 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
DEF6Q9H4E7 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
DEF6Q9H4E7 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
DEF6Q9H4E7 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
DEF6Q9H4E7 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
DEF6Q9H4E7 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
DEF6Q9H4E7 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
DEF6Q9H4E7 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
DEF6Q9H4E7 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
DEF6Q9H4E7 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
DEF6Q9H4E7 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
DEF6Q9H4E7 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
DEF6Q9H4E7 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
DEF6Q9H4E7 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
DEF6Q9H4E7 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
DEF6Q9H4E7 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
DEF6Q9H4E7 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
DEF6Q9H4E7 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
DEF6Q9H4E7 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
DEF6Q9H4E7 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
DEF6Q9H4E7 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
DEF6Q9H4E7 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
DEF6Q9H4E7 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
DEF6Q9H4E7 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
DEF6Q9H4E7 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
DEF6Q9H4E7 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
DEF6Q9H4E7 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
DEF6Q9H4E7 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
DEF6Q9H4E7 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
DEF6Q9H4E7 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
DEF6Q9H4E7 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
DEF6Q9H4E7 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
DEF6Q9H4E7 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
DEF6Q9H4E7 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
DEF6Q9H4E7 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
DEF6Q9H4E7 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
DEF6Q9H4E7 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
DEF6Q9H4E7 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
DEF6Q9H4E7 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
DEF6Q9H4E7 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
DEF6Q9H4E7 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
DEF6Q9H4E7 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
DEF6Q9H4E7 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
DEF6Q9H4E7 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
DEF6Q9H4E7 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
DEF6Q9H4E7 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
DEF6Q9H4E7 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
DEF6Q9H4E7 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
DEF6Q9H4E7 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
DEF6Q9H4E7 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms