Protein–RNA interactions for Protein: Q9H446

RWDD1, RWD domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RWDD1Q9H446 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
RWDD1Q9H446 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
RWDD1Q9H446 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
RWDD1Q9H446 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
RWDD1Q9H446 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC28.22■■■□□ 2.11
RWDD1Q9H446 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
RWDD1Q9H446 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
RWDD1Q9H446 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
RWDD1Q9H446 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
RWDD1Q9H446 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
RWDD1Q9H446 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC28.22■■■□□ 2.11
RWDD1Q9H446 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
RWDD1Q9H446 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
RWDD1Q9H446 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
RWDD1Q9H446 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC28.22■■■□□ 2.11
RWDD1Q9H446 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
RWDD1Q9H446 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
RWDD1Q9H446 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
RWDD1Q9H446 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
RWDD1Q9H446 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
RWDD1Q9H446 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
RWDD1Q9H446 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
RWDD1Q9H446 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
RWDD1Q9H446 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
RWDD1Q9H446 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
RWDD1Q9H446 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
RWDD1Q9H446 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
RWDD1Q9H446 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
RWDD1Q9H446 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
RWDD1Q9H446 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
RWDD1Q9H446 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
RWDD1Q9H446 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
RWDD1Q9H446 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
RWDD1Q9H446 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
RWDD1Q9H446 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
RWDD1Q9H446 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
RWDD1Q9H446 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
RWDD1Q9H446 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
RWDD1Q9H446 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
RWDD1Q9H446 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
RWDD1Q9H446 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
RWDD1Q9H446 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
RWDD1Q9H446 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
RWDD1Q9H446 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
RWDD1Q9H446 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
RWDD1Q9H446 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC28.18■■■□□ 2.1
RWDD1Q9H446 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
RWDD1Q9H446 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
RWDD1Q9H446 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
RWDD1Q9H446 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
RWDD1Q9H446 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
RWDD1Q9H446 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
RWDD1Q9H446 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
RWDD1Q9H446 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
RWDD1Q9H446 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC28.16■■■□□ 2.1
RWDD1Q9H446 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
RWDD1Q9H446 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
RWDD1Q9H446 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
RWDD1Q9H446 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
RWDD1Q9H446 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
RWDD1Q9H446 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
RWDD1Q9H446 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
RWDD1Q9H446 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
RWDD1Q9H446 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
RWDD1Q9H446 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
RWDD1Q9H446 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
RWDD1Q9H446 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
RWDD1Q9H446 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
RWDD1Q9H446 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
RWDD1Q9H446 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
RWDD1Q9H446 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
RWDD1Q9H446 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
RWDD1Q9H446 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
RWDD1Q9H446 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC28.14■■■□□ 2.09
RWDD1Q9H446 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.09
RWDD1Q9H446 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
RWDD1Q9H446 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
RWDD1Q9H446 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
RWDD1Q9H446 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC28.13■■■□□ 2.09
RWDD1Q9H446 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
RWDD1Q9H446 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
RWDD1Q9H446 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
RWDD1Q9H446 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC28.12■■■□□ 2.09
RWDD1Q9H446 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
RWDD1Q9H446 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
RWDD1Q9H446 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
RWDD1Q9H446 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
RWDD1Q9H446 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
RWDD1Q9H446 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
RWDD1Q9H446 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
RWDD1Q9H446 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
RWDD1Q9H446 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
RWDD1Q9H446 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
RWDD1Q9H446 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
RWDD1Q9H446 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
RWDD1Q9H446 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
RWDD1Q9H446 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
RWDD1Q9H446 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
RWDD1Q9H446 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
RWDD1Q9H446 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms